More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3322 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  55.51 
 
 
696 aa  736    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  100 
 
 
688 aa  1397    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  50.51 
 
 
688 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  58.35 
 
 
719 aa  786    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  65.61 
 
 
698 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  65.8 
 
 
698 aa  919    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  52.05 
 
 
782 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  50.36 
 
 
685 aa  641    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  59.16 
 
 
706 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  67.64 
 
 
690 aa  938    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  51.73 
 
 
744 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  53 
 
 
703 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  52.39 
 
 
739 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  56.3 
 
 
726 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  78.02 
 
 
695 aa  1105    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  59.16 
 
 
706 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  57.18 
 
 
712 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  59.01 
 
 
706 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  59.89 
 
 
709 aa  819    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  58.53 
 
 
706 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  48.9 
 
 
686 aa  631  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  49.34 
 
 
682 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  48.4 
 
 
726 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  43.75 
 
 
721 aa  588  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  48.63 
 
 
699 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.4 
 
 
711 aa  585  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  44.53 
 
 
686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.67 
 
 
671 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  44.99 
 
 
748 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  46.14 
 
 
678 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  46.81 
 
 
690 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  44.19 
 
 
697 aa  558  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  43.19 
 
 
705 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  43.44 
 
 
686 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  44.91 
 
 
710 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  45.84 
 
 
678 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  43.91 
 
 
686 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  42.28 
 
 
696 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  44.65 
 
 
708 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  44.73 
 
 
680 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  44.73 
 
 
680 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  44.77 
 
 
697 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  44.41 
 
 
700 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  43.98 
 
 
680 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  44.27 
 
 
685 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  44.41 
 
 
680 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  42.94 
 
 
691 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  43.79 
 
 
701 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  45.36 
 
 
717 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  43.27 
 
 
709 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  41.56 
 
 
696 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  44.73 
 
 
696 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  43.39 
 
 
701 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  43.06 
 
 
685 aa  524  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  43.97 
 
 
713 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  44.84 
 
 
682 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  42.26 
 
 
711 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  43.19 
 
 
702 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  42.26 
 
 
711 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  42.75 
 
 
702 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  42.26 
 
 
711 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  43.6 
 
 
702 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  42.12 
 
 
711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  43.27 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  43.95 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  43.4 
 
 
684 aa  515  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  42.92 
 
 
701 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  42.28 
 
 
715 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  43.47 
 
 
698 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  44.41 
 
 
703 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  42.86 
 
 
697 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  42.98 
 
 
678 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  44.38 
 
 
715 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  41.61 
 
 
711 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  41.7 
 
 
691 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  42.54 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  42.77 
 
 
683 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  43.43 
 
 
695 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  41.88 
 
 
686 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  41.88 
 
 
686 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  41.18 
 
 
711 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  41.43 
 
 
677 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  41.75 
 
 
716 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  42.47 
 
 
683 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  41.18 
 
 
711 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  41.88 
 
 
686 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  41.74 
 
 
686 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  41.98 
 
 
702 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40.89 
 
 
700 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  41.59 
 
 
686 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.89 
 
 
711 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  44.49 
 
 
714 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  42.12 
 
 
702 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  41.74 
 
 
686 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  43.58 
 
 
717 aa  505  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  43.29 
 
 
739 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  43.14 
 
 
711 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  42.55 
 
 
683 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  41.74 
 
 
686 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  41.3 
 
 
683 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>