More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3230 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  48.54 
 
 
698 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  49.86 
 
 
706 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  48.54 
 
 
698 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  52.39 
 
 
688 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  84.41 
 
 
744 aa  1300    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  100 
 
 
739 aa  1508    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  47.64 
 
 
709 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  49.86 
 
 
706 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  49.72 
 
 
719 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  49.03 
 
 
712 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  53.64 
 
 
748 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  49.72 
 
 
706 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  50 
 
 
695 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  50.28 
 
 
706 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  47.06 
 
 
690 aa  635  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  46.52 
 
 
696 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  45.18 
 
 
726 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  45.52 
 
 
703 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  44.72 
 
 
726 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.42 
 
 
688 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.77 
 
 
711 aa  502  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  37.47 
 
 
838 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  39.6 
 
 
682 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.31 
 
 
678 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  39.8 
 
 
686 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.45 
 
 
685 aa  485  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.3 
 
 
699 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  39.28 
 
 
710 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.61 
 
 
702 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  37.43 
 
 
705 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  38.34 
 
 
702 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  40.88 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  39.04 
 
 
680 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  36.45 
 
 
686 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  40.59 
 
 
739 aa  459  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  37.8 
 
 
686 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.19 
 
 
702 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  36.38 
 
 
721 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  39.14 
 
 
690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.12 
 
 
680 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  37.3 
 
 
709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  38.69 
 
 
680 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  37.22 
 
 
671 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  37.69 
 
 
678 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  38.05 
 
 
680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  35.18 
 
 
686 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.27 
 
 
698 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  37.64 
 
 
684 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  37.64 
 
 
715 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  36.46 
 
 
700 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  36.77 
 
 
701 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  36.61 
 
 
696 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  36.02 
 
 
719 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  37.32 
 
 
685 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  37.92 
 
 
708 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  37.82 
 
 
696 aa  439  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  36.99 
 
 
703 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  37.04 
 
 
683 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  37.04 
 
 
683 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  37.04 
 
 
683 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  38.15 
 
 
711 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  36.83 
 
 
705 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  36.84 
 
 
702 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  36.57 
 
 
702 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  37.66 
 
 
701 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  36.69 
 
 
717 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  36.54 
 
 
711 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  36.11 
 
 
701 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  37.34 
 
 
714 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  36.67 
 
 
691 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  37.25 
 
 
713 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  35.73 
 
 
715 aa  425  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.36 
 
 
713 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  36.06 
 
 
677 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  36.29 
 
 
697 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  37.08 
 
 
696 aa  422  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  37.5 
 
 
715 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  36.4 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  34.57 
 
 
697 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  36.51 
 
 
678 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  37.03 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  34.41 
 
 
686 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  35.99 
 
 
683 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  34.56 
 
 
691 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  34.41 
 
 
686 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  35.5 
 
 
711 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  36.01 
 
 
683 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  35.5 
 
 
711 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  35.47 
 
 
697 aa  416  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  35.71 
 
 
700 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  34.13 
 
 
686 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  34.41 
 
 
686 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  35.91 
 
 
711 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  36.53 
 
 
697 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  36.89 
 
 
703 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  34.27 
 
 
686 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  36.18 
 
 
711 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  35.77 
 
 
711 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  35.76 
 
 
711 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  35.77 
 
 
711 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>