More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2641 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  49.63 
 
 
688 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  81.89 
 
 
682 aa  1143    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  53.65 
 
 
678 aa  698    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  100 
 
 
686 aa  1404    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  49.2 
 
 
685 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  48.41 
 
 
688 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  47.51 
 
 
686 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  48.64 
 
 
698 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  44.75 
 
 
686 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  44.8 
 
 
697 aa  622  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  48.13 
 
 
696 aa  621  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  45.89 
 
 
721 aa  618  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  47.56 
 
 
698 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  47.08 
 
 
690 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  46.8 
 
 
705 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  46.61 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  43.29 
 
 
711 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  45.99 
 
 
695 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  46.5 
 
 
719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  45.57 
 
 
696 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  45.53 
 
 
686 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  43.7 
 
 
683 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  43.7 
 
 
683 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  45.7 
 
 
706 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  45.29 
 
 
700 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  45.7 
 
 
706 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  45.85 
 
 
706 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  43.7 
 
 
683 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  45.15 
 
 
699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  45.21 
 
 
709 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  43.59 
 
 
696 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  44.36 
 
 
683 aa  561  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  42.98 
 
 
696 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  42.27 
 
 
719 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  44.94 
 
 
712 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  44.2 
 
 
701 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  44.24 
 
 
782 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  45.44 
 
 
680 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  43.6 
 
 
702 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.68 
 
 
710 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  43.19 
 
 
701 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  42.96 
 
 
708 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  43.6 
 
 
702 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  43.86 
 
 
697 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  44.7 
 
 
680 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  44.49 
 
 
678 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  44.41 
 
 
680 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  44.25 
 
 
683 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  44.27 
 
 
683 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  44.74 
 
 
690 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  43.98 
 
 
703 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  43.13 
 
 
677 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  44.86 
 
 
706 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.64 
 
 
713 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  40.92 
 
 
704 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  44.12 
 
 
698 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  44.33 
 
 
686 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  42.86 
 
 
697 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  44.56 
 
 
680 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  43.81 
 
 
711 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  43.08 
 
 
726 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  43.41 
 
 
717 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  42.26 
 
 
711 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  44.33 
 
 
678 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  42.53 
 
 
705 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  43.94 
 
 
702 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  44.16 
 
 
682 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  43.9 
 
 
703 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  42.71 
 
 
695 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  44.17 
 
 
684 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  41.95 
 
 
691 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  42.96 
 
 
713 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  41.79 
 
 
701 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  43.37 
 
 
711 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  42.41 
 
 
715 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  42.14 
 
 
686 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  42.14 
 
 
686 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  42.15 
 
 
691 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  42.31 
 
 
683 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  43.37 
 
 
711 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  43.52 
 
 
711 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  43.08 
 
 
714 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  43.37 
 
 
711 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  41.94 
 
 
709 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  42 
 
 
686 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  42.63 
 
 
702 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  41.17 
 
 
725 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  42 
 
 
686 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  42 
 
 
686 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  42.82 
 
 
711 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  43.23 
 
 
711 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  42 
 
 
686 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  42.55 
 
 
711 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  42.14 
 
 
686 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  42.17 
 
 
683 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  42 
 
 
686 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  42.45 
 
 
700 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  43.45 
 
 
685 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  43.37 
 
 
711 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  43.02 
 
 
697 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>