More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2471 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0568  protease II  59.1 
 
 		 702 aa  841    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  59.48 
 
 		 710 aa  823    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  55.99 
 
 		 709 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 695 aa  1425    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  57.1 
 
 		 702 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  57.84 
 
 		 702 aa  801    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  78.27 
 
 		 708 aa  1144    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  77.81 
 
 		 717 aa  1093    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  57.55 
 
 		 699 aa  824    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  78.88 
 
 		 713 aa  1132    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  60.2 
 
 		 715 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  90.22 
 
 		 697 aa  1305    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  78.37 
 
 		 705 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  58.5 
 
 		 701 aa  834    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  59.21 
 
 		 700 aa  851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  57.4 
 
 		 702 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  62.45 
 
 		 714 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  62.44 
 
 		 698 aa  853    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  52.03 
 
 		 756 aa  728    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  60.97 
 
 		 713 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  63.64 
 
 		 711 aa  882    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  59.77 
 
 		 715 aa  848    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  50.87 
 
 		 695 aa  688    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  58.72 
 
 		 701 aa  833    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  60.29 
 
 		 714 aa  839    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  51.3 
 
 		 696 aa  733    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  53.25 
 
 		 701 aa  762    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  54.59 
 
 		 696 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  79.45 
 
 		 703 aa  1140    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  52.94 
 
 		 696 aa  705    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  58.95 
 
 		 702 aa  840    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  47.84 
 
 		 697 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  47.09 
 
 		 710 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  45.48 
 
 		 715 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  46.68 
 
 		 691 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  41.16 
 
 		 721 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  40.38 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.79 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  41.5 
 
 		 705 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  42 
 
 		 682 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.87 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  41.84 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.46 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  41.42 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.67 
 
 		 696 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.43 
 
 		 688 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.72 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.48 
 
 		 678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.92 
 
 		 695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  39.83 
 
 		 725 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  42.57 
 
 		 698 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.37 
 
 		 698 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.24 
 
 		 711 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.33 
 
 		 726 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  39.77 
 
 		 697 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.12 
 
 		 690 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  38.72 
 
 		 719 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.64 
 
 		 683 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.64 
 
 		 683 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.64 
 
 		 683 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.58 
 
 		 677 aa  492  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  40.9 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.18 
 
 		 678 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  40.9 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  40.76 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  40.28 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.28 
 
 		 710 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.53 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  40.61 
 
 		 683 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  39.44 
 
 		 719 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  39.6 
 
 		 680 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.74 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  39.59 
 
 		 683 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.13 
 
 		 709 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  39.6 
 
 		 683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  38.75 
 
 		 722 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  39.29 
 
 		 682 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  39.6 
 
 		 683 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.68 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  39 
 
 		 696 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  38.65 
 
 		 712 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  38.12 
 
 		 685 aa  460  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  38.58 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  38.17 
 
 		 683 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  38.8 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  36.67 
 
 		 697 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.83 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  38.25 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  38.39 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  38.25 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  38.25 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  38.25 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  37.83 
 
 		 711 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  38.1 
 
 		 686 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  37.83 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  39.09 
 
 		 685 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.32 
 
 		 684 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  37.83 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  37.83 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  38.01 
 
 		 739 aa  452  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>