More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2995 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  60.72 
 
 
691 aa  875    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  100 
 
 
715 aa  1459    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  61.99 
 
 
697 aa  846    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  45.22 
 
 
702 aa  581  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  45.74 
 
 
708 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  45.22 
 
 
702 aa  581  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  45.93 
 
 
699 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  42.82 
 
 
688 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  45.2 
 
 
717 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  44.69 
 
 
701 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  42.48 
 
 
721 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  45.48 
 
 
695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  43.54 
 
 
701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  44.54 
 
 
700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  43.11 
 
 
686 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  45.11 
 
 
713 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  43.11 
 
 
696 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  45.49 
 
 
705 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  44.46 
 
 
697 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  42.9 
 
 
696 aa  552  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  44.13 
 
 
698 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  44.59 
 
 
703 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  43.97 
 
 
709 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  45.01 
 
 
702 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  42.92 
 
 
705 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  44.28 
 
 
702 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  42.45 
 
 
697 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  43.84 
 
 
702 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  43.01 
 
 
671 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.51 
 
 
711 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  43.69 
 
 
714 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  42.44 
 
 
715 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  42.61 
 
 
710 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.87 
 
 
711 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.7 
 
 
713 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  42.32 
 
 
711 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  41.96 
 
 
683 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  42.82 
 
 
714 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  41.96 
 
 
683 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  41.96 
 
 
683 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.9 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  42.88 
 
 
715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  41.18 
 
 
710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  41.4 
 
 
756 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  41.65 
 
 
677 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  41.05 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.28 
 
 
688 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  40.31 
 
 
698 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  40.71 
 
 
722 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  41.11 
 
 
695 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  40.37 
 
 
698 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.58 
 
 
685 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.69 
 
 
697 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  41.64 
 
 
686 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.94 
 
 
686 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  42.06 
 
 
678 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  40.26 
 
 
696 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  40.82 
 
 
701 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  41.09 
 
 
678 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  38.68 
 
 
725 aa  502  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  40.97 
 
 
686 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  40.62 
 
 
683 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  39.88 
 
 
683 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40.92 
 
 
700 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  40.89 
 
 
711 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  40.91 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  40.78 
 
 
711 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  39.91 
 
 
710 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  40.47 
 
 
683 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  40.66 
 
 
711 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  39.77 
 
 
691 aa  492  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  36.93 
 
 
719 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  40.8 
 
 
711 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  40.52 
 
 
696 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  40.94 
 
 
711 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.84 
 
 
711 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  39.04 
 
 
726 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  41.91 
 
 
703 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  40.94 
 
 
711 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  39.56 
 
 
686 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  39.71 
 
 
686 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  39.56 
 
 
686 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  38.59 
 
 
690 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  39.56 
 
 
686 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  40.84 
 
 
711 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.56 
 
 
686 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  39.71 
 
 
686 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.56 
 
 
686 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  40.43 
 
 
739 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  40.57 
 
 
717 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  40.91 
 
 
706 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  41.28 
 
 
686 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  37.59 
 
 
704 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  40.35 
 
 
695 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  40.77 
 
 
706 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  40.61 
 
 
716 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  39.56 
 
 
686 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  40.77 
 
 
706 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  39.27 
 
 
683 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  39.27 
 
 
683 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>