More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4559 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  57.99 
 
 
696 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  59.16 
 
 
688 aa  786    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  49.86 
 
 
744 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  100 
 
 
706 aa  1439    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  56.51 
 
 
695 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  56.41 
 
 
698 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  49.86 
 
 
739 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  53.17 
 
 
782 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  57.51 
 
 
726 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  50.07 
 
 
703 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  100 
 
 
706 aa  1439    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  80.32 
 
 
712 aa  1165    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  61.26 
 
 
709 aa  870    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  99.58 
 
 
706 aa  1433    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  79.02 
 
 
719 aa  1157    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  56.87 
 
 
690 aa  780    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  81.46 
 
 
706 aa  1175    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  57.14 
 
 
698 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  46.62 
 
 
688 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  46.92 
 
 
748 aa  594  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  46.15 
 
 
726 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  44.81 
 
 
685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.61 
 
 
711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  46.13 
 
 
686 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  45.69 
 
 
682 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  47.06 
 
 
680 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  47.34 
 
 
684 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  46.99 
 
 
680 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  46.15 
 
 
686 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.55 
 
 
686 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  46.55 
 
 
680 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  46.39 
 
 
680 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  42.44 
 
 
671 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  41.9 
 
 
705 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  46.15 
 
 
685 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.17 
 
 
721 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  44.63 
 
 
699 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  45.7 
 
 
678 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  43.29 
 
 
686 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  43.87 
 
 
682 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  45.2 
 
 
696 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  44.37 
 
 
683 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  44.19 
 
 
683 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  41.23 
 
 
697 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  43.08 
 
 
678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  42.63 
 
 
683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  42.53 
 
 
683 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  41.12 
 
 
697 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.86 
 
 
713 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.76 
 
 
710 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  44.38 
 
 
711 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.88 
 
 
696 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  42.05 
 
 
709 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  41.87 
 
 
698 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  42.41 
 
 
691 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  44.51 
 
 
714 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  41.63 
 
 
701 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  43.79 
 
 
717 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  41.23 
 
 
696 aa  502  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  42.21 
 
 
700 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  42.72 
 
 
703 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  41.73 
 
 
686 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  40.51 
 
 
719 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  42.21 
 
 
678 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  41.87 
 
 
710 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  39.86 
 
 
677 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  42.04 
 
 
705 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  41.21 
 
 
702 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  41.32 
 
 
708 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  41.97 
 
 
715 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  42.37 
 
 
739 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  40.91 
 
 
683 aa  492  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  39.24 
 
 
683 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  41.5 
 
 
713 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  41.55 
 
 
697 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  39.24 
 
 
683 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  39.24 
 
 
683 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  42.9 
 
 
690 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  41.44 
 
 
702 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  38.3 
 
 
725 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  41.44 
 
 
702 aa  482  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  41.8 
 
 
717 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  42.44 
 
 
714 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  40.51 
 
 
701 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.77 
 
 
715 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  40.9 
 
 
695 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  39.17 
 
 
722 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24161  predicted protein  40.86 
 
 
812 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.314931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  42.39 
 
 
715 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  40.14 
 
 
685 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.24 
 
 
702 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.24 
 
 
702 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  38.65 
 
 
696 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.24 
 
 
701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  37.91 
 
 
704 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  41.63 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  39.09 
 
 
691 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  38.46 
 
 
729 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  38.36 
 
 
686 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  38.36 
 
 
686 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>