More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  75.18 
 
 
680 aa  1044    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  97.8 
 
 
683 aa  1354    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  74.23 
 
 
685 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  75.33 
 
 
682 aa  1058    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  75.55 
 
 
686 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  73.78 
 
 
684 aa  1014    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  75.18 
 
 
680 aa  1041    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  75.62 
 
 
680 aa  1051    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  100 
 
 
683 aa  1384    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  78.58 
 
 
678 aa  1096    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  75.33 
 
 
680 aa  1043    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  45.97 
 
 
685 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  42.17 
 
 
688 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  39.26 
 
 
686 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  42.9 
 
 
682 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  44.04 
 
 
726 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  44.48 
 
 
706 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  44.19 
 
 
706 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  42.24 
 
 
709 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  44.19 
 
 
706 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  40.12 
 
 
686 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  44.67 
 
 
696 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.69 
 
 
686 aa  525  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.75 
 
 
721 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  44.49 
 
 
696 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  42.35 
 
 
719 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.61 
 
 
697 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  42.75 
 
 
683 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.9 
 
 
705 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.47 
 
 
688 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  43.28 
 
 
678 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  41.9 
 
 
712 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  41.7 
 
 
677 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.61 
 
 
711 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.35 
 
 
683 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.35 
 
 
683 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  39.08 
 
 
696 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  42 
 
 
706 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.35 
 
 
683 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  39.08 
 
 
696 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.4 
 
 
711 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.23 
 
 
695 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  43.34 
 
 
698 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.04 
 
 
690 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.7 
 
 
698 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.18 
 
 
697 aa  492  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.34 
 
 
710 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  40.34 
 
 
729 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  40.29 
 
 
722 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  41.45 
 
 
683 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  37.66 
 
 
671 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  41.42 
 
 
683 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  42.1 
 
 
686 aa  482  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  39.94 
 
 
704 aa  479  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  40.64 
 
 
678 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  40.44 
 
 
698 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  40.88 
 
 
697 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  42.07 
 
 
703 aa  475  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.85 
 
 
702 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.92 
 
 
699 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  40.92 
 
 
690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  40 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  42.67 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  38.31 
 
 
685 aa  468  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  41.35 
 
 
711 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  41.35 
 
 
711 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  41.35 
 
 
711 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  41.2 
 
 
711 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.91 
 
 
691 aa  465  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  37.41 
 
 
719 aa  462  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40.91 
 
 
700 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  39.45 
 
 
708 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  41.27 
 
 
716 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  41 
 
 
711 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.6 
 
 
700 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  38.67 
 
 
701 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  42.71 
 
 
703 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.6 
 
 
695 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  40.32 
 
 
711 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  40.32 
 
 
711 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  38.59 
 
 
701 aa  459  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  40.47 
 
 
696 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.18 
 
 
709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  38.24 
 
 
715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.03 
 
 
711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  39.21 
 
 
683 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  37.81 
 
 
725 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  39.21 
 
 
683 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  39.12 
 
 
705 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  39.21 
 
 
683 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  39.59 
 
 
717 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  39.21 
 
 
683 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  39.21 
 
 
683 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  38.17 
 
 
686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  41.13 
 
 
710 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.65 
 
 
756 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  38.02 
 
 
686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  38.45 
 
 
702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  39.8 
 
 
703 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  38.17 
 
 
686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>