More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4371 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000831  putative protease  55.04 
 
 		 696 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  53.03 
 
 		 704 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  55.36 
 
 		 719 aa  826    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  68.25 
 
 		 700 aa  1003    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  70.23 
 
 		 716 aa  1046    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  75.1 
 
 		 722 aa  1135    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  51.15 
 
 		 683 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  48.42 
 
 		 683 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  68.84 
 
 		 711 aa  1018    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  48.2 
 
 		 683 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  51.15 
 
 		 683 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  100 
 
 		 729 aa  1499    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  48.96 
 
 		 705 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  49.86 
 
 		 683 aa  676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  45.99 
 
 		 686 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  69.11 
 
 		 711 aa  1019    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  68.12 
 
 		 711 aa  1000    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  48.63 
 
 		 686 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  67.98 
 
 		 711 aa  998    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  50.51 
 
 		 677 aa  695    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  66.99 
 
 		 711 aa  991    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  44.64 
 
 		 721 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  45.93 
 
 		 711 aa  662    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  67.98 
 
 		 711 aa  998    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  54.03 
 
 		 696 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  52.09 
 
 		 725 aa  765    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  63.01 
 
 		 703 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  48.97 
 
 		 678 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  51.44 
 
 		 697 aa  700    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  68.98 
 
 		 711 aa  1018    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  51.15 
 
 		 683 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  68.84 
 
 		 711 aa  1016    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  67.77 
 
 		 686 aa  944    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  47.04 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  46.9 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  47.04 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  46.9 
 
 		 686 aa  631  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  46.9 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  46.68 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  46.68 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  46.68 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  47.04 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  47.47 
 
 		 683 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  47.47 
 
 		 683 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  47.47 
 
 		 683 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  47.11 
 
 		 683 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  47.62 
 
 		 683 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  46.61 
 
 		 710 aa  625  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  45.08 
 
 		 711 aa  615  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  44.88 
 
 		 686 aa  612  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.27 
 
 		 671 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  45.99 
 
 		 739 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  45.34 
 
 		 717 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  42.26 
 
 		 688 aa  559  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  41.24 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.99 
 
 		 685 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  41.01 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  40.64 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  40.14 
 
 		 688 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  38.97 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  39.22 
 
 		 699 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.34 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  39.69 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  40.03 
 
 		 678 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.57 
 
 		 701 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.48 
 
 		 683 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  37.85 
 
 		 726 aa  482  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  38.47 
 
 		 715 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  40.11 
 
 		 685 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  38.69 
 
 		 702 aa  475  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  39.77 
 
 		 680 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.8 
 
 		 680 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  38.69 
 
 		 702 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  39.52 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  39.77 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.35 
 
 		 700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  38.52 
 
 		 719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.28 
 
 		 686 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  38.62 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  38.17 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  38.92 
 
 		 685 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  39.37 
 
 		 702 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.41 
 
 		 709 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.66 
 
 		 702 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  37.97 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  36.81 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  37.75 
 
 		 698 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  38.46 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  38.46 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  38.6 
 
 		 706 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  37.07 
 
 		 709 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.4 
 
 		 702 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  37.45 
 
 		 701 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  37.64 
 
 		 717 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  37.83 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  38.27 
 
 		 703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  37.8 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  36.52 
 
 		 756 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  38.05 
 
 		 684 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  37.01 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>