More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3911 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  79.67 
 
 		 680 aa  1122    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  100 
 
 		 685 aa  1405    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  92.55 
 
 		 686 aa  1320    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  80.12 
 
 		 680 aa  1130    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  79.68 
 
 		 684 aa  1129    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  74.45 
 
 		 678 aa  1045    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  71.39 
 
 		 682 aa  998    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  79.09 
 
 		 680 aa  1120    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  74.23 
 
 		 683 aa  1046    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  79.53 
 
 		 680 aa  1121    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  73.78 
 
 		 683 aa  1037    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  47.07 
 
 		 685 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  44.69 
 
 		 688 aa  559  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  43.91 
 
 		 709 aa  548  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  46.3 
 
 		 706 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  46.15 
 
 		 706 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  46.15 
 
 		 706 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  43.24 
 
 		 719 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.9 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  44.69 
 
 		 696 aa  531  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  44.27 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  43.13 
 
 		 686 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  41.61 
 
 		 721 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  42.69 
 
 		 682 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  44.54 
 
 		 726 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  43.75 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  43.45 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  42.75 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  42.75 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  45 
 
 		 696 aa  512  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  42.75 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  43.24 
 
 		 706 aa  515  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  42.65 
 
 		 677 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.3 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  41.84 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  40.69 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  43.75 
 
 		 695 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  41.88 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.6 
 
 		 698 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  43.5 
 
 		 698 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  40.57 
 
 		 704 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.89 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  43.22 
 
 		 686 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  43.11 
 
 		 678 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  42.2 
 
 		 710 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  42.58 
 
 		 683 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  38.76 
 
 		 696 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.82 
 
 		 696 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.52 
 
 		 711 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  41.52 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.42 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  41.39 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  38.99 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  39.76 
 
 		 685 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  39.61 
 
 		 722 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  42.37 
 
 		 710 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  40.62 
 
 		 686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  40.62 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  40.62 
 
 		 686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  40.62 
 
 		 678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.88 
 
 		 699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  40.5 
 
 		 700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  40.77 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  40.62 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  40.33 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  40.83 
 
 		 701 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  40.48 
 
 		 686 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  40.33 
 
 		 686 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  40.18 
 
 		 683 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  40.18 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  40.18 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.55 
 
 		 713 aa  465  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  40.33 
 
 		 683 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  39.62 
 
 		 715 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  40.18 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  38.92 
 
 		 729 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  40.12 
 
 		 698 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  40.24 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  40.26 
 
 		 782 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  37.88 
 
 		 719 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 701 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  41.81 
 
 		 714 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.56 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.26 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  39.12 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  39.44 
 
 		 715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  39.97 
 
 		 716 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  40.55 
 
 		 711 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.26 
 
 		 709 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  40.59 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  40.06 
 
 		 697 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.06 
 
 		 702 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  36.74 
 
 		 725 aa  452  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  40.06 
 
 		 697 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  38.03 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  38.89 
 
 		 708 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  37.68 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>