More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0431 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  55.05 
 
 		 702 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  55.7 
 
 		 702 aa  771    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  61.95 
 
 		 705 aa  866    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  55.06 
 
 		 701 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  59.97 
 
 		 695 aa  840    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  57.97 
 
 		 710 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  59.52 
 
 		 699 aa  843    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  52.88 
 
 		 696 aa  709    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  61.66 
 
 		 708 aa  885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  52.99 
 
 		 701 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  61.99 
 
 		 717 aa  866    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  60.2 
 
 		 698 aa  848    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  60.96 
 
 		 713 aa  856    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  99.16 
 
 		 715 aa  1444    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  60.86 
 
 		 697 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  55.67 
 
 		 702 aa  773    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  74.18 
 
 		 714 aa  1028    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  75.68 
 
 		 711 aa  1070    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  57.33 
 
 		 700 aa  798    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  55.05 
 
 		 702 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  74.86 
 
 		 713 aa  1046    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  54.4 
 
 		 709 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  50.14 
 
 		 756 aa  704    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  62.2 
 
 		 703 aa  855    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  100 
 
 		 715 aa  1454    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  96.29 
 
 		 714 aa  1335    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  47.4 
 
 		 696 aa  684    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  57.14 
 
 		 702 aa  784    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  55.78 
 
 		 696 aa  768    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  60.37 
 
 		 701 aa  834    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  50.36 
 
 		 695 aa  679    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  49.71 
 
 		 710 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  41.85 
 
 		 721 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  44.6 
 
 		 697 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  42.9 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  40.72 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  41.04 
 
 		 688 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  43.08 
 
 		 682 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  42.47 
 
 		 715 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  42.96 
 
 		 678 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.28 
 
 		 705 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  44.18 
 
 		 698 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.63 
 
 		 686 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  37.93 
 
 		 686 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.95 
 
 		 688 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  43.58 
 
 		 698 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  41.71 
 
 		 726 aa  515  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.43 
 
 		 678 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.22 
 
 		 711 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.18 
 
 		 710 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.63 
 
 		 685 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  41.23 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.43 
 
 		 690 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.98 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.37 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  40.9 
 
 		 719 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.98 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.98 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  41.26 
 
 		 717 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  41.26 
 
 		 739 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  40.57 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.2 
 
 		 680 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.5 
 
 		 680 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  40.78 
 
 		 712 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.54 
 
 		 680 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  38.63 
 
 		 725 aa  482  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.68 
 
 		 680 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  37.18 
 
 		 697 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  37.23 
 
 		 696 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  37.52 
 
 		 696 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.73 
 
 		 686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  39.61 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  38.67 
 
 		 690 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  39.62 
 
 		 685 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.65 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  39.06 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  39.69 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.69 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  37.09 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  39.69 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  37.55 
 
 		 683 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  37.75 
 
 		 685 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  36.72 
 
 		 704 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  35.71 
 
 		 719 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  39.54 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  39.26 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  39.08 
 
 		 682 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  39.26 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  40.43 
 
 		 703 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  39.69 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  39.12 
 
 		 711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  37.48 
 
 		 711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  37.27 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  38.56 
 
 		 678 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  38.1 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  37.69 
 
 		 739 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  38.39 
 
 		 683 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  37.61 
 
 		 686 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  38.41 
 
 		 700 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  37.45 
 
 		 744 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>