More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0821 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  47.02 
 
 
711 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  100 
 
 
717 aa  1476    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  97.91 
 
 
739 aa  1427    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  49.1 
 
 
711 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  45.96 
 
 
686 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  49.24 
 
 
711 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  75.18 
 
 
678 aa  1061    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  47.98 
 
 
683 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  47.98 
 
 
683 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  48.63 
 
 
721 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  71.27 
 
 
710 aa  1045    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  48.62 
 
 
677 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  47.18 
 
 
686 aa  639    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  48.81 
 
 
705 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  49.24 
 
 
711 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  47.98 
 
 
683 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  49.31 
 
 
711 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  48.69 
 
 
711 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  49.15 
 
 
711 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  47.25 
 
 
722 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  48.91 
 
 
697 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  48.31 
 
 
696 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  47.6 
 
 
696 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  49.01 
 
 
711 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  48.85 
 
 
711 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  48.58 
 
 
700 aa  621  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  47.61 
 
 
716 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  46.62 
 
 
719 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  45.62 
 
 
729 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  44.84 
 
 
711 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  46.98 
 
 
671 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  48.74 
 
 
703 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  44.91 
 
 
686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  46.81 
 
 
686 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  44.77 
 
 
686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  44.91 
 
 
686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  44.91 
 
 
686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  44.77 
 
 
686 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  44.99 
 
 
686 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  45.39 
 
 
683 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  44.99 
 
 
686 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  44.48 
 
 
686 aa  595  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  46.26 
 
 
725 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  45.79 
 
 
691 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  45.04 
 
 
683 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  46.1 
 
 
683 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  44.46 
 
 
704 aa  588  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  44.74 
 
 
683 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  44.74 
 
 
683 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  44.74 
 
 
683 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  44.74 
 
 
683 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  44.74 
 
 
683 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  45.7 
 
 
686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  42.55 
 
 
688 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  42.86 
 
 
699 aa  551  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  42.88 
 
 
697 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.06 
 
 
685 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.58 
 
 
688 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  40.28 
 
 
701 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  43.05 
 
 
690 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.99 
 
 
690 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.79 
 
 
726 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  41.6 
 
 
698 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  41.67 
 
 
685 aa  499  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  41.06 
 
 
715 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  41.68 
 
 
686 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  40.93 
 
 
698 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  40.48 
 
 
696 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  41.8 
 
 
719 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.8 
 
 
706 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  41.51 
 
 
714 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.8 
 
 
706 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  40.46 
 
 
698 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.79 
 
 
695 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.57 
 
 
715 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.8 
 
 
706 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  40.15 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  40.96 
 
 
709 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  41.86 
 
 
678 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  41.21 
 
 
715 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  40.88 
 
 
700 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  41.31 
 
 
712 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  39.08 
 
 
701 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  40.5 
 
 
682 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  40.17 
 
 
708 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  41.43 
 
 
706 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.36 
 
 
702 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  40.88 
 
 
739 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  41.44 
 
 
696 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.52 
 
 
702 aa  479  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  41.06 
 
 
703 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.31 
 
 
713 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.5 
 
 
702 aa  479  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.38 
 
 
702 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  39.21 
 
 
744 aa  475  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.86 
 
 
680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.37 
 
 
691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  39.29 
 
 
711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  40.34 
 
 
713 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  39.77 
 
 
714 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>