More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0132 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01816  protease II  47.86 
 
 
686 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  47.86 
 
 
686 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  50.51 
 
 
683 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  54.18 
 
 
704 aa  777    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  56.94 
 
 
719 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  72.22 
 
 
700 aa  1034    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  71.03 
 
 
729 aa  1064    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  50.81 
 
 
683 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  48.31 
 
 
686 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  73.14 
 
 
722 aa  1088    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  48.16 
 
 
683 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  50.29 
 
 
677 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  46.55 
 
 
711 aa  680    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  47.72 
 
 
686 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  49.78 
 
 
683 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  73.12 
 
 
711 aa  1050    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  50.29 
 
 
686 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  50.07 
 
 
683 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  48.31 
 
 
683 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  50.51 
 
 
683 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  59.88 
 
 
696 aa  833    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  54.57 
 
 
725 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  48.31 
 
 
683 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  48.31 
 
 
683 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  73.5 
 
 
711 aa  1050    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  48.54 
 
 
710 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  73.07 
 
 
711 aa  1039    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  47.86 
 
 
686 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  47.86 
 
 
686 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  47.72 
 
 
686 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  48.31 
 
 
686 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  73.4 
 
 
711 aa  1051    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  73.21 
 
 
711 aa  1045    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  58.63 
 
 
696 aa  817    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  48.82 
 
 
678 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  50.51 
 
 
683 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  66.32 
 
 
703 aa  896    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  100 
 
 
716 aa  1477    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  45.75 
 
 
721 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  71.55 
 
 
711 aa  1028    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  50.66 
 
 
697 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  73.26 
 
 
711 aa  1052    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  47.86 
 
 
686 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  73.26 
 
 
711 aa  1050    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  48.01 
 
 
691 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  49.51 
 
 
705 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  67.25 
 
 
686 aa  939    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  48.31 
 
 
683 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  48.8 
 
 
739 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  45.95 
 
 
711 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  46.54 
 
 
686 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  47.55 
 
 
717 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.24 
 
 
671 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  44.22 
 
 
688 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  42.4 
 
 
685 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  41.75 
 
 
688 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  39.48 
 
 
697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  41.32 
 
 
686 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  39.14 
 
 
690 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.61 
 
 
715 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.8 
 
 
702 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  38.9 
 
 
726 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.26 
 
 
678 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.65 
 
 
702 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  39.38 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  40.82 
 
 
702 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  40.2 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.89 
 
 
691 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  40.52 
 
 
702 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.77 
 
 
709 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  39.77 
 
 
702 aa  492  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  37.77 
 
 
699 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.68 
 
 
700 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.31 
 
 
701 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  39.86 
 
 
698 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  40.46 
 
 
685 aa  485  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.95 
 
 
695 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.54 
 
 
680 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  39.01 
 
 
698 aa  485  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  38.9 
 
 
719 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  40.71 
 
 
686 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  41.27 
 
 
683 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  39.94 
 
 
678 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  38.79 
 
 
696 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  39.97 
 
 
685 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.95 
 
 
680 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.8 
 
 
680 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  37.37 
 
 
701 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.52 
 
 
698 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  39.02 
 
 
717 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.11 
 
 
709 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.98 
 
 
683 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  39.08 
 
 
706 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  37.95 
 
 
708 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  40.44 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  38.94 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  38.94 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  38.68 
 
 
713 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  39.33 
 
 
706 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  37.48 
 
 
756 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>