More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01816 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01816  protease II  100 
 
 		 686 aa  1432    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  99.42 
 
 		 686 aa  1422    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  99.13 
 
 		 686 aa  1419    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  47.97 
 
 		 704 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  65.24 
 
 		 677 aa  939    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1291    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  48.69 
 
 		 711 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  49.26 
 
 		 696 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  61.97 
 
 		 683 aa  882    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  49.85 
 
 		 721 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  51.76 
 
 		 705 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  63.82 
 
 		 683 aa  929    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  64.3 
 
 		 683 aa  927    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  48.55 
 
 		 711 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  79.88 
 
 		 691 aa  1194    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  48.4 
 
 		 711 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  48.97 
 
 		 696 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  99.13 
 
 		 686 aa  1419    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1293    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  89.56 
 
 		 683 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  47.21 
 
 		 686 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  100 
 
 		 686 aa  1432    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  98.69 
 
 		 686 aa  1415    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1292    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  63.82 
 
 		 683 aa  929    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  49.7 
 
 		 703 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  47.86 
 
 		 716 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  52.79 
 
 		 697 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  47.64 
 
 		 711 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  63.7 
 
 		 683 aa  923    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  99.71 
 
 		 686 aa  1429    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  55.08 
 
 		 711 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1291    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  48.55 
 
 		 711 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  63.82 
 
 		 683 aa  929    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  60.62 
 
 		 686 aa  868    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  98.98 
 
 		 686 aa  1416    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  46.46 
 
 		 719 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  47.19 
 
 		 722 aa  635  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  46.98 
 
 		 725 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  46.9 
 
 		 729 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  48.54 
 
 		 711 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  47.95 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  47.66 
 
 		 700 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  47.81 
 
 		 711 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  46.56 
 
 		 671 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  46.74 
 
 		 688 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  47.51 
 
 		 711 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  47.51 
 
 		 711 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  47.1 
 
 		 710 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  46.57 
 
 		 678 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  46.54 
 
 		 686 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  45.94 
 
 		 739 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  44.91 
 
 		 717 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  42.37 
 
 		 697 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.59 
 
 		 685 aa  524  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  41.99 
 
 		 686 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.39 
 
 		 682 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  42.28 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  41.74 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.79 
 
 		 680 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.59 
 
 		 680 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.34 
 
 		 695 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  39.48 
 
 		 696 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.65 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  39.56 
 
 		 715 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  40.15 
 
 		 678 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.5 
 
 		 690 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  39.4 
 
 		 699 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.71 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.42 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.71 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  40.27 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  37.92 
 
 		 698 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.62 
 
 		 685 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  38.21 
 
 		 698 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.57 
 
 		 709 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.5 
 
 		 684 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  38.98 
 
 		 708 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.72 
 
 		 756 aa  465  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  38.01 
 
 		 709 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  38.17 
 
 		 697 aa  462  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.22 
 
 		 702 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  38.3 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  39.8 
 
 		 713 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.22 
 
 		 702 aa  458  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  38.07 
 
 		 719 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  38.78 
 
 		 717 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  38.22 
 
 		 706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  37.54 
 
 		 726 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  38.22 
 
 		 706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  38.36 
 
 		 706 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.38 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  38.86 
 
 		 701 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  38.43 
 
 		 702 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  38.62 
 
 		 705 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  38.26 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  37.35 
 
 		 701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  38.97 
 
 		 702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.83 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>