More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3959 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  88.79 
 
 		 705 aa  1276    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  60.64 
 
 		 702 aa  852    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  58.82 
 
 		 702 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  58.53 
 
 		 702 aa  817    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  78.27 
 
 		 695 aa  1126    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  61.47 
 
 		 698 aa  857    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  100 
 
 		 708 aa  1444    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  82.08 
 
 		 717 aa  1160    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  91.09 
 
 		 713 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  62.11 
 
 		 715 aa  867    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  78.13 
 
 		 697 aa  1145    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  64.1 
 
 		 714 aa  879    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  63.94 
 
 		 711 aa  884    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  59.63 
 
 		 699 aa  839    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  59.29 
 
 		 700 aa  851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  59.08 
 
 		 701 aa  830    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  57.52 
 
 		 710 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  51.73 
 
 		 756 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  63.1 
 
 		 714 aa  872    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  51.23 
 
 		 695 aa  684    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  57.43 
 
 		 709 aa  821    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  58.09 
 
 		 702 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  61.68 
 
 		 715 aa  876    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  63.09 
 
 		 713 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  59.17 
 
 		 701 aa  839    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  51.9 
 
 		 696 aa  746    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  54.17 
 
 		 696 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  55.01 
 
 		 696 aa  760    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  60.64 
 
 		 702 aa  853    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  81.77 
 
 		 703 aa  1171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  54.44 
 
 		 701 aa  754    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  48.42 
 
 		 697 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  47.84 
 
 		 710 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  45.98 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  45.74 
 
 		 715 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.65 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  41.47 
 
 		 688 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  42.21 
 
 		 721 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  41.68 
 
 		 705 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.05 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  41.98 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  41.31 
 
 		 696 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.65 
 
 		 686 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  44.65 
 
 		 688 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  40.82 
 
 		 686 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  42.04 
 
 		 671 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.56 
 
 		 682 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.86 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.96 
 
 		 690 aa  522  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  43.32 
 
 		 695 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  40.14 
 
 		 725 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  42.54 
 
 		 698 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  39.57 
 
 		 719 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.08 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  42.65 
 
 		 678 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.25 
 
 		 698 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.64 
 
 		 726 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  41.28 
 
 		 678 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.73 
 
 		 677 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.51 
 
 		 710 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.32 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.32 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.18 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  39.42 
 
 		 683 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  39.97 
 
 		 719 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.33 
 
 		 709 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  39.94 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  39.83 
 
 		 685 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  38.75 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  38.75 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  38.75 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  38.75 
 
 		 683 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  39.6 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  39.36 
 
 		 712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  39.12 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  40.09 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  40.17 
 
 		 717 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  38.98 
 
 		 686 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  39.02 
 
 		 680 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.17 
 
 		 680 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  38.72 
 
 		 686 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.12 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  38.05 
 
 		 722 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  38.98 
 
 		 686 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.12 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  38.98 
 
 		 686 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  38.98 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  38.98 
 
 		 686 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.5 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  38.96 
 
 		 696 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  39.11 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  38.21 
 
 		 711 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  39.45 
 
 		 683 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  39.24 
 
 		 680 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  38.54 
 
 		 683 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  36.91 
 
 		 704 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  39.45 
 
 		 683 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  38.21 
 
 		 711 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  37.41 
 
 		 697 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  38.87 
 
 		 706 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>