299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2902 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  63.17 
 
 		 711 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  58.64 
 
 		 702 aa  840    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  77.79 
 
 		 705 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  90.22 
 
 		 695 aa  1282    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  56.05 
 
 		 702 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  80.2 
 
 		 703 aa  1144    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  78.13 
 
 		 708 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  52.88 
 
 		 701 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  79.12 
 
 		 717 aa  1098    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  78.74 
 
 		 713 aa  1126    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  61.22 
 
 		 715 aa  844    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  100 
 
 		 697 aa  1427    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  63.35 
 
 		 714 aa  857    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  57.71 
 
 		 702 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  58 
 
 		 701 aa  825    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  61.46 
 
 		 714 aa  848    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  56.49 
 
 		 702 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  59.01 
 
 		 700 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  50.8 
 
 		 695 aa  681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  55.12 
 
 		 709 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  60.82 
 
 		 698 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  52.32 
 
 		 756 aa  721    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  58.21 
 
 		 710 aa  812    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  61.26 
 
 		 713 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  60.78 
 
 		 715 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  50 
 
 		 696 aa  722    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  54.7 
 
 		 696 aa  759    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  52.65 
 
 		 696 aa  695    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  59.68 
 
 		 701 aa  837    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  58.64 
 
 		 702 aa  840    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  57.61 
 
 		 699 aa  821    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  47.3 
 
 		 710 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  48.41 
 
 		 697 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.24 
 
 		 686 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  45.44 
 
 		 691 aa  554  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  44.46 
 
 		 715 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.35 
 
 		 721 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.79 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  42.04 
 
 		 686 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  41.61 
 
 		 705 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  41.33 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.79 
 
 		 686 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.09 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.59 
 
 		 682 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.96 
 
 		 711 aa  519  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  43.14 
 
 		 698 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.64 
 
 		 685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  39.8 
 
 		 696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.8 
 
 		 698 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.86 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.25 
 
 		 678 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.49 
 
 		 695 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.83 
 
 		 726 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  38.86 
 
 		 719 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  39.11 
 
 		 725 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  39.19 
 
 		 697 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.18 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.46 
 
 		 690 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.55 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.55 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.99 
 
 		 677 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.41 
 
 		 706 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  39.22 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  39.22 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  40.2 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  39.22 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.43 
 
 		 710 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.59 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.88 
 
 		 683 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.88 
 
 		 683 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  40.46 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.41 
 
 		 709 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  40.9 
 
 		 682 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  39.19 
 
 		 719 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  39.16 
 
 		 711 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  38.58 
 
 		 722 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  39.13 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  39.22 
 
 		 712 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.71 
 
 		 680 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  39.42 
 
 		 680 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  38.99 
 
 		 711 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  38.99 
 
 		 711 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.39 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  39.51 
 
 		 696 aa  462  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  38.99 
 
 		 711 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  38.99 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  37.3 
 
 		 685 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.07 
 
 		 686 aa  458  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.82 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  38.86 
 
 		 711 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  37.83 
 
 		 683 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  38.86 
 
 		 711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  36.81 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.06 
 
 		 685 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  38.57 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  38.61 
 
 		 739 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  37.23 
 
 		 686 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 678 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  37.23 
 
 		 686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  37.23 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>