More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4087 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  75.18 
 
 
680 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  73.78 
 
 
685 aa  1037    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  74.96 
 
 
686 aa  1053    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  73.34 
 
 
684 aa  1007    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  75.18 
 
 
680 aa  1038    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  75.47 
 
 
680 aa  1047    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  100 
 
 
683 aa  1383    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  97.8 
 
 
683 aa  1354    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  75.47 
 
 
680 aa  1040    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  75.33 
 
 
682 aa  1050    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  79.32 
 
 
678 aa  1103    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  45.68 
 
 
685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  41.74 
 
 
688 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  42.9 
 
 
682 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  38.97 
 
 
686 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  44.65 
 
 
706 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  44.37 
 
 
706 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  44.37 
 
 
706 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  43.62 
 
 
726 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  42.11 
 
 
719 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  39.97 
 
 
686 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.7 
 
 
721 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.79 
 
 
686 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  41.84 
 
 
709 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  44.26 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  44.44 
 
 
696 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  42.98 
 
 
683 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  41.76 
 
 
712 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  42 
 
 
677 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.38 
 
 
705 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.17 
 
 
697 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.55 
 
 
688 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  42 
 
 
706 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.84 
 
 
678 aa  502  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.66 
 
 
695 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.73 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.92 
 
 
698 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.65 
 
 
711 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  39.31 
 
 
696 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.35 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.35 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  39.17 
 
 
696 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.35 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  43.26 
 
 
698 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  40.82 
 
 
711 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.18 
 
 
697 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  41.74 
 
 
683 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  40.09 
 
 
704 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  42.22 
 
 
686 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  40.76 
 
 
710 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  40.58 
 
 
722 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  41.51 
 
 
683 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  40.48 
 
 
729 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.38 
 
 
690 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  40.88 
 
 
697 aa  475  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  37.5 
 
 
671 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.8 
 
 
699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  41.96 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  41.44 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.06 
 
 
701 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  40.18 
 
 
678 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  39.91 
 
 
698 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.42 
 
 
702 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  41.35 
 
 
711 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  37.55 
 
 
719 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.27 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  41.2 
 
 
711 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.77 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  41.2 
 
 
711 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  37.64 
 
 
685 aa  458  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  41.06 
 
 
700 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.6 
 
 
695 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  39.45 
 
 
708 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.44 
 
 
709 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  41.06 
 
 
711 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  38.37 
 
 
701 aa  459  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  40.71 
 
 
696 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  40.98 
 
 
716 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  41.14 
 
 
711 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.6 
 
 
700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  42.34 
 
 
703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  37.95 
 
 
725 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  37.91 
 
 
715 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  40.32 
 
 
711 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  40.05 
 
 
782 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  40.32 
 
 
711 aa  452  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  39.06 
 
 
683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  39.97 
 
 
713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.03 
 
 
711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  39.07 
 
 
701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  39.65 
 
 
703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  39.06 
 
 
683 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  39.06 
 
 
683 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  38.17 
 
 
686 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  37.89 
 
 
702 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  38.7 
 
 
705 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  39.06 
 
 
683 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  38.56 
 
 
702 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  38.13 
 
 
686 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  38.17 
 
 
686 aa  445  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>