More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  53 
 
 		 688 aa  690    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  50.63 
 
 		 709 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  100 
 
 		 703 aa  1411    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  51.56 
 
 		 698 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  50.07 
 
 		 706 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  51.44 
 
 		 690 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  48.79 
 
 		 719 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  50.07 
 
 		 706 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  48.44 
 
 		 712 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  51.14 
 
 		 695 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  49.93 
 
 		 706 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  49.28 
 
 		 706 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  51.77 
 
 		 698 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  49.1 
 
 		 726 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  49.14 
 
 		 696 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  48.95 
 
 		 726 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  45.53 
 
 		 744 aa  595  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  45.52 
 
 		 739 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  45.33 
 
 		 748 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03470  protease II  44.46 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.24 
 
 		 682 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.02 
 
 		 685 aa  500  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.79 
 
 		 710 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  41 
 
 		 686 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.53 
 
 		 696 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  38.35 
 
 		 686 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  36.89 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.16 
 
 		 678 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  39.77 
 
 		 678 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  42.69 
 
 		 680 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  38.51 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  37.57 
 
 		 705 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.08 
 
 		 690 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  37.82 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  40.7 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  38.55 
 
 		 683 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  37.09 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  38.55 
 
 		 683 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  41.89 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  39.48 
 
 		 683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.89 
 
 		 680 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  39.38 
 
 		 701 aa  469  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.5 
 
 		 711 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  41.04 
 
 		 686 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  42.3 
 
 		 680 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  38.22 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  41.06 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  38.22 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  38.22 
 
 		 683 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  39.57 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  39.57 
 
 		 697 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  38.32 
 
 		 677 aa  462  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  42.84 
 
 		 682 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  42.71 
 
 		 683 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  37.39 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  42.34 
 
 		 683 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  37.39 
 
 		 715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  37.68 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  37.68 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  40.96 
 
 		 678 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.53 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.34 
 
 		 686 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  37.68 
 
 		 686 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  37.54 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  37.64 
 
 		 686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  37.15 
 
 		 702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  37.25 
 
 		 686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  37.59 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  37.39 
 
 		 686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  37.59 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  37.59 
 
 		 683 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  37.54 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  36.18 
 
 		 722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  37.59 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  37.29 
 
 		 702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  37.59 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  37.46 
 
 		 711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  37.59 
 
 		 701 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.67 
 
 		 713 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.41 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  37.9 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  35.99 
 
 		 725 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  39.6 
 
 		 698 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  39.15 
 
 		 717 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  36.79 
 
 		 671 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  39.42 
 
 		 703 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  35.88 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.94 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  37.67 
 
 		 708 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  37.83 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  37.55 
 
 		 702 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  37.52 
 
 		 709 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  37.06 
 
 		 700 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  36.83 
 
 		 702 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  39.07 
 
 		 703 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  37.71 
 
 		 716 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  37.97 
 
 		 697 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  37.27 
 
 		 702 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  35.17 
 
 		 729 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>