More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0568 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  57.31 
 
 
714 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  100 
 
 
702 aa  1449    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  59.1 
 
 
695 aa  833    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  60.55 
 
 
705 aa  827    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  99.57 
 
 
702 aa  1445    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  69.21 
 
 
709 aa  1007    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  71.53 
 
 
702 aa  1030    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  60.64 
 
 
708 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  59.71 
 
 
717 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  61.31 
 
 
703 aa  840    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  51.1 
 
 
696 aa  686    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  53.14 
 
 
710 aa  745    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  59.51 
 
 
713 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  56.28 
 
 
715 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  58.64 
 
 
697 aa  840    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  61.07 
 
 
699 aa  865    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  69.34 
 
 
700 aa  1014    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  55.68 
 
 
714 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  71.2 
 
 
702 aa  1027    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  50.94 
 
 
756 aa  720    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  50.07 
 
 
695 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  55.18 
 
 
713 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  55.84 
 
 
715 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  56.19 
 
 
701 aa  803    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  54.96 
 
 
711 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  89.66 
 
 
701 aa  1304    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  62.86 
 
 
696 aa  941    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  53.27 
 
 
696 aa  749    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  71.49 
 
 
702 aa  1031    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  53.2 
 
 
701 aa  734    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  59.12 
 
 
698 aa  826    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  46.49 
 
 
697 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  45.22 
 
 
715 aa  581  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  43.33 
 
 
688 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  44.33 
 
 
710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  45.12 
 
 
686 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  42.77 
 
 
705 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  44.94 
 
 
691 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  42.42 
 
 
686 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.17 
 
 
711 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  43.05 
 
 
682 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  42.24 
 
 
721 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  43.97 
 
 
686 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  42.14 
 
 
671 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.72 
 
 
696 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.71 
 
 
678 aa  525  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  40.55 
 
 
725 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  39.42 
 
 
719 aa  515  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.84 
 
 
683 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.84 
 
 
683 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.41 
 
 
696 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  41.5 
 
 
685 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.84 
 
 
683 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  41.68 
 
 
697 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  41.74 
 
 
695 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  41.58 
 
 
698 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.02 
 
 
710 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.09 
 
 
677 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  39.86 
 
 
726 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  41.98 
 
 
688 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  42.47 
 
 
690 aa  502  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  40.84 
 
 
683 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  40.17 
 
 
722 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  40 
 
 
704 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  40.97 
 
 
698 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.81 
 
 
678 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  41.21 
 
 
711 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.92 
 
 
709 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  41.07 
 
 
711 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  39.48 
 
 
683 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.92 
 
 
711 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40.49 
 
 
700 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  39.77 
 
 
711 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  38.92 
 
 
683 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  40.49 
 
 
711 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  40.63 
 
 
711 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  40.78 
 
 
711 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  40.78 
 
 
711 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  40.87 
 
 
686 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.53 
 
 
686 aa  478  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  40.92 
 
 
711 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  40.17 
 
 
719 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.2 
 
 
680 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  39.65 
 
 
716 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  38.69 
 
 
729 aa  475  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  39.24 
 
 
706 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  39.24 
 
 
706 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  39.24 
 
 
706 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  39.94 
 
 
739 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  39.85 
 
 
683 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  40.5 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.91 
 
 
680 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  39.52 
 
 
717 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  39.27 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.86 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.22 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  38.89 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.22 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  39.22 
 
 
686 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  38.97 
 
 
680 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>