More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1258 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0568  protease II  69.21 
 
 		 702 aa  1007    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  54.39 
 
 		 711 aa  769    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  54.57 
 
 		 701 aa  768    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  55.99 
 
 		 695 aa  796    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  81.31 
 
 		 702 aa  1192    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  100 
 
 		 709 aa  1459    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  57.43 
 
 		 708 aa  821    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  57.8 
 
 		 717 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  48.69 
 
 		 696 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  57.74 
 
 		 703 aa  804    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  57 
 
 		 713 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  54.96 
 
 		 715 aa  752    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  55.12 
 
 		 697 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  48.41 
 
 		 695 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  58.53 
 
 		 699 aa  837    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  64.71 
 
 		 700 aa  951    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  55.97 
 
 		 714 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  50.22 
 
 		 701 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  53.23 
 
 		 713 aa  741    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  51.22 
 
 		 756 aa  735    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  54.53 
 
 		 715 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  49.93 
 
 		 710 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  69.9 
 
 		 701 aa  1011    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  80.88 
 
 		 702 aa  1186    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  69.35 
 
 		 702 aa  1008    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  59.04 
 
 		 696 aa  869    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  53.1 
 
 		 714 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  49.43 
 
 		 696 aa  691    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  79.32 
 
 		 702 aa  1164    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  56.66 
 
 		 705 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  57.58 
 
 		 698 aa  807    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  44.43 
 
 		 705 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  44.65 
 
 		 710 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.86 
 
 		 711 aa  578  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  46.2 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  42.47 
 
 		 721 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  43.13 
 
 		 686 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  44.86 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  43.97 
 
 		 715 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  42.9 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  40.86 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  42.27 
 
 		 671 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.63 
 
 		 695 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.27 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  43.69 
 
 		 678 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.7 
 
 		 710 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  41.95 
 
 		 698 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.39 
 
 		 698 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  40.66 
 
 		 719 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.34 
 
 		 686 aa  522  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.68 
 
 		 682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.4 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.84 
 
 		 690 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.43 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  41.91 
 
 		 719 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  39.75 
 
 		 725 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  42.05 
 
 		 706 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.45 
 
 		 726 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  42.05 
 
 		 706 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  41.31 
 
 		 709 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.91 
 
 		 706 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  41.28 
 
 		 704 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  41.9 
 
 		 711 aa  502  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.03 
 
 		 697 aa  502  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  41.62 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  41.76 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  41.76 
 
 		 711 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  40.93 
 
 		 711 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.26 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  40.94 
 
 		 711 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.12 
 
 		 685 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  42.84 
 
 		 703 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  40.11 
 
 		 711 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40.36 
 
 		 700 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  39.02 
 
 		 677 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  40.86 
 
 		 711 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  40.29 
 
 		 683 aa  485  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  41.18 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  40.5 
 
 		 711 aa  485  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  39.37 
 
 		 683 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  39.37 
 
 		 683 aa  482  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  41.3 
 
 		 739 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  39.37 
 
 		 683 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  40.67 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  40.96 
 
 		 717 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  39.86 
 
 		 686 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.86 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  38.67 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  39.77 
 
 		 716 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  39.11 
 
 		 683 aa  475  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.86 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  40 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  39.86 
 
 		 686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.76 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  39.83 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.68 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  39.86 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  39.71 
 
 		 686 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  40.8 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  39.48 
 
 		 683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>