More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6532 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01816  protease II  49.85 
 
 		 686 aa  688    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  49.85 
 
 		 686 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  57.49 
 
 		 711 aa  862    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  49.85 
 
 		 686 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  46.89 
 
 		 704 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  47.83 
 
 		 719 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  47.03 
 
 		 700 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  45.56 
 
 		 729 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  49.19 
 
 		 683 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  50.07 
 
 		 683 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  58.41 
 
 		 686 aa  847    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  50.3 
 
 		 686 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  46.83 
 
 		 711 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  46.88 
 
 		 739 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  50.87 
 
 		 688 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  50.15 
 
 		 686 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  50.37 
 
 		 683 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  53.37 
 
 		 683 aa  743    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  50.15 
 
 		 686 aa  693    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  49.19 
 
 		 683 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  49.26 
 
 		 697 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  53.37 
 
 		 683 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  62.28 
 
 		 671 aa  889    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  48.76 
 
 		 685 aa  662    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  45.03 
 
 		 722 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  49.19 
 
 		 683 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  47.01 
 
 		 711 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  52.29 
 
 		 677 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  49.19 
 
 		 683 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  47.66 
 
 		 711 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  45.75 
 
 		 716 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  51.13 
 
 		 710 aa  680    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  52.23 
 
 		 678 aa  688    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  61.17 
 
 		 705 aa  893    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  55.18 
 
 		 686 aa  771    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  48.63 
 
 		 717 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  47.45 
 
 		 711 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  50.95 
 
 		 696 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  45.87 
 
 		 711 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  49.33 
 
 		 703 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  45.87 
 
 		 711 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  48.26 
 
 		 725 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  49.93 
 
 		 697 aa  702    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  49.85 
 
 		 686 aa  688    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  51.25 
 
 		 696 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  51.55 
 
 		 683 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  49.19 
 
 		 683 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  45.87 
 
 		 711 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  53.37 
 
 		 683 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  100 
 
 		 721 aa  1506    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  49.71 
 
 		 686 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  50 
 
 		 686 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  48.82 
 
 		 691 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  45.94 
 
 		 711 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  45.74 
 
 		 711 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  46.18 
 
 		 678 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  44.82 
 
 		 699 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  46.48 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  46.06 
 
 		 686 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  45.74 
 
 		 682 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  44.17 
 
 		 701 aa  604  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  45.95 
 
 		 685 aa  594  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  42.54 
 
 		 726 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.75 
 
 		 688 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  42.57 
 
 		 696 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  44.22 
 
 		 695 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  42.51 
 
 		 698 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  43.25 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.46 
 
 		 698 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  43.11 
 
 		 702 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  42.48 
 
 		 715 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  44.49 
 
 		 690 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.6 
 
 		 713 aa  568  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  40.95 
 
 		 711 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  41.87 
 
 		 698 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  42.21 
 
 		 708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  41.65 
 
 		 715 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  41.83 
 
 		 700 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  42.47 
 
 		 709 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  42.52 
 
 		 702 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  40.56 
 
 		 714 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  43.11 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  42.22 
 
 		 713 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  41.4 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  42.38 
 
 		 702 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  41.51 
 
 		 715 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  42.41 
 
 		 701 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  41.4 
 
 		 697 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  41.35 
 
 		 696 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  42.3 
 
 		 703 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  41.21 
 
 		 717 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  42.38 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  41.61 
 
 		 705 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  40.35 
 
 		 697 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  41.23 
 
 		 701 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  42.46 
 
 		 680 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  42.24 
 
 		 702 aa  545  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  42.48 
 
 		 680 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  42.11 
 
 		 680 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  41.15 
 
 		 719 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>