More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4105 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  51.77 
 
 		 703 aa  676    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  55.22 
 
 		 696 aa  708    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  61.69 
 
 		 690 aa  869    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  61.63 
 
 		 695 aa  862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  47.4 
 
 		 688 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  93.84 
 
 		 698 aa  1345    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  57.14 
 
 		 706 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  54.8 
 
 		 709 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  65.8 
 
 		 688 aa  919    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  52.37 
 
 		 782 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  48.54 
 
 		 739 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  55.62 
 
 		 726 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  100 
 
 		 698 aa  1416    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  57.14 
 
 		 706 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  56.63 
 
 		 712 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  57.12 
 
 		 706 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  56.55 
 
 		 719 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  55.81 
 
 		 706 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  47.99 
 
 		 744 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  49.06 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  48.54 
 
 		 682 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  47.75 
 
 		 699 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  48.35 
 
 		 726 aa  598  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  48.14 
 
 		 685 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  42.51 
 
 		 721 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  43.39 
 
 		 705 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.4 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  46.01 
 
 		 748 aa  575  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  43.55 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  45.95 
 
 		 678 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.21 
 
 		 711 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  44.72 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  42.55 
 
 		 686 aa  545  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  44.6 
 
 		 696 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  46.16 
 
 		 680 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  41.95 
 
 		 697 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  43.02 
 
 		 698 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  45.87 
 
 		 680 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  43.35 
 
 		 690 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  41.95 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  45.62 
 
 		 680 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.34 
 
 		 713 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  45.34 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  44.3 
 
 		 715 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  42.78 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  46.05 
 
 		 714 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  43.14 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  44.43 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  42.58 
 
 		 701 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  41.32 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  42.54 
 
 		 708 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  41.32 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  43.66 
 
 		 678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  43.29 
 
 		 701 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  41.32 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  43.63 
 
 		 686 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  44.44 
 
 		 715 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  42.55 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  43.5 
 
 		 717 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  44.4 
 
 		 703 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  41.95 
 
 		 701 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  41.58 
 
 		 702 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  41.73 
 
 		 702 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.14 
 
 		 696 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  43.06 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  41.83 
 
 		 702 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.66 
 
 		 697 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  40.52 
 
 		 683 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  39.74 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  44.59 
 
 		 714 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  43.4 
 
 		 678 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  40.58 
 
 		 683 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  43.5 
 
 		 685 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  41.33 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  43.22 
 
 		 684 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  39.86 
 
 		 685 aa  498  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  41.39 
 
 		 686 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  42.57 
 
 		 695 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  41.86 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  41.57 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.17 
 
 		 677 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  44.25 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  42.21 
 
 		 713 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  43 
 
 		 697 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  43.34 
 
 		 683 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  43.26 
 
 		 683 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  42.05 
 
 		 739 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  41.6 
 
 		 717 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  38.53 
 
 		 696 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  38.23 
 
 		 719 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  40.4 
 
 		 710 aa  485  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  40.56 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  40.56 
 
 		 711 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  40.56 
 
 		 711 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  40.28 
 
 		 711 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.9 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  38 
 
 		 725 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  39.97 
 
 		 711 aa  482  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  38.35 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>