More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3621 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  53.53 
 
 
690 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  55.51 
 
 
688 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  53.79 
 
 
695 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  57.99 
 
 
706 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  56.7 
 
 
709 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  46.96 
 
 
744 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  53.02 
 
 
726 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  50.33 
 
 
782 aa  661    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  57.99 
 
 
706 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  56.34 
 
 
712 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  54.34 
 
 
698 aa  703    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  100 
 
 
696 aa  1409    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  56.88 
 
 
719 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  57.99 
 
 
706 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  56.47 
 
 
706 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  55.22 
 
 
698 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  49.14 
 
 
703 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  46.52 
 
 
739 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  47.78 
 
 
748 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  45.85 
 
 
685 aa  587  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  45.94 
 
 
686 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  42.77 
 
 
688 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.64 
 
 
711 aa  571  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  38.85 
 
 
818 aa  568  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  43.4 
 
 
682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  41.7 
 
 
671 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  46.21 
 
 
680 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  46.36 
 
 
680 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  40.26 
 
 
686 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  46.65 
 
 
680 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  45.99 
 
 
680 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  41.35 
 
 
721 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  42.94 
 
 
705 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  42.07 
 
 
697 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  44.92 
 
 
686 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  45.26 
 
 
726 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  44.69 
 
 
685 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  44.14 
 
 
678 aa  529  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  44.3 
 
 
684 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  44.35 
 
 
678 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  41.34 
 
 
686 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.78 
 
 
710 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  44.49 
 
 
683 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  41.53 
 
 
697 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  44.26 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  41.68 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  41.73 
 
 
678 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  40.12 
 
 
725 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  42.41 
 
 
686 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  42.06 
 
 
683 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  40.51 
 
 
691 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.26 
 
 
715 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  43.18 
 
 
699 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  42.38 
 
 
683 aa  505  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  41.13 
 
 
683 aa  502  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  39.63 
 
 
686 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  39.48 
 
 
686 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.63 
 
 
686 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.63 
 
 
686 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  43 
 
 
682 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  39.48 
 
 
686 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  39.2 
 
 
683 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  39.48 
 
 
686 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  39.63 
 
 
686 aa  492  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  39.2 
 
 
683 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  39.2 
 
 
683 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  39.48 
 
 
686 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  39.49 
 
 
683 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.88 
 
 
696 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  39.66 
 
 
683 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  39.52 
 
 
683 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  39.52 
 
 
683 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  39.52 
 
 
683 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  41.5 
 
 
701 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  38.83 
 
 
696 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.83 
 
 
690 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  39.74 
 
 
677 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  39.8 
 
 
719 aa  482  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  41.36 
 
 
696 aa  478  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  40.28 
 
 
717 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  40.37 
 
 
711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  37.59 
 
 
704 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  40 
 
 
709 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  41.58 
 
 
739 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  40.37 
 
 
703 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  38.17 
 
 
729 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  40.29 
 
 
698 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  41.44 
 
 
717 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.09 
 
 
700 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  39.8 
 
 
703 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  38.96 
 
 
708 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  39.51 
 
 
697 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  37.8 
 
 
722 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.14 
 
 
713 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  40.69 
 
 
697 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  40.2 
 
 
702 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.97 
 
 
702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  39.18 
 
 
711 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.18 
 
 
711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  38.99 
 
 
715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>