More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0302 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  100 
 
 		 818 aa  1714    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  56.92 
 
 		 838 aa  999    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  38.33 
 
 		 709 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  38.85 
 
 		 696 aa  568  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  38.16 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  33.25 
 
 		 726 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  31.67 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  33.37 
 
 		 686 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  32.62 
 
 		 678 aa  406  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  30.54 
 
 		 722 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  31 
 
 		 721 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  30.84 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  30.72 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  30.73 
 
 		 705 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  30.46 
 
 		 680 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  30.58 
 
 		 700 aa  348  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  49.41 
 
 		 712 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  49.27 
 
 		 706 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  49.7 
 
 		 719 aa  334  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  30.93 
 
 		 710 aa  333  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  49.85 
 
 		 698 aa  320  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  28.69 
 
 		 696 aa  320  7.999999999999999e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  48.94 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  48.94 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  48.94 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  49.7 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  49.7 
 
 		 698 aa  318  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  47.06 
 
 		 726 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  41.54 
 
 		 739 aa  310  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  45.88 
 
 		 744 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  29.5 
 
 		 702 aa  308  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  29.46 
 
 		 702 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  45.92 
 
 		 690 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  48.62 
 
 		 695 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  48 
 
 		 683 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  45.17 
 
 		 697 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.07 
 
 		 696 aa  297  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  44.31 
 
 		 696 aa  297  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  43.11 
 
 		 719 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  45.43 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  44.72 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  44.72 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  44.72 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  46.08 
 
 		 677 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  44.28 
 
 		 703 aa  287  5.999999999999999e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  43.7 
 
 		 729 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  43.34 
 
 		 704 aa  285  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  44.38 
 
 		 678 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  42.89 
 
 		 703 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  46.32 
 
 		 686 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  43.69 
 
 		 683 aa  283  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  43.15 
 
 		 711 aa  281  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.94 
 
 		 685 aa  281  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  44.08 
 
 		 748 aa  280  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  43.21 
 
 		 671 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  46.08 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  46.08 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  46.08 
 
 		 686 aa  280  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  46.08 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  46.08 
 
 		 686 aa  280  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  46.08 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  46.08 
 
 		 686 aa  278  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  46.39 
 
 		 683 aa  277  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  46.39 
 
 		 683 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  46.39 
 
 		 683 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  46.39 
 
 		 683 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  46.39 
 
 		 683 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  45.77 
 
 		 686 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  45.22 
 
 		 686 aa  276  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  45.77 
 
 		 711 aa  273  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  41.41 
 
 		 725 aa  273  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  41.98 
 
 		 688 aa  270  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  48.32 
 
 		 700 aa  270  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  44.38 
 
 		 711 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  44.55 
 
 		 716 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  47.81 
 
 		 711 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  47.81 
 
 		 711 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  42.25 
 
 		 684 aa  267  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  47.81 
 
 		 711 aa  267  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  43.57 
 
 		 691 aa  266  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  42.81 
 
 		 685 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  42.55 
 
 		 680 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  47.47 
 
 		 711 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  46.8 
 
 		 711 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  46.8 
 
 		 711 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  46.8 
 
 		 711 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  43.2 
 
 		 686 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  42.86 
 
 		 701 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  42.25 
 
 		 680 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.95 
 
 		 680 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  43.5 
 
 		 739 aa  260  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  43.5 
 
 		 717 aa  259  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  41.64 
 
 		 702 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  41.95 
 
 		 709 aa  258  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  42.9 
 
 		 682 aa  255  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.12 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.64 
 
 		 713 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  37.53 
 
 		 686 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  38.59 
 
 		 701 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.23 
 
 		 699 aa  250  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>