More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1835 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01816  protease II  64.3 
 
 		 686 aa  927    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  64.44 
 
 		 686 aa  929    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  69.79 
 
 		 683 aa  1019    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  69.79 
 
 		 683 aa  1019    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  49.13 
 
 		 704 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  48.32 
 
 		 719 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  48.7 
 
 		 700 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  64.15 
 
 		 686 aa  924    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  65.13 
 
 		 683 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  47.18 
 
 		 686 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  65.13 
 
 		 683 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  64.44 
 
 		 686 aa  928    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  65.13 
 
 		 683 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  51.4 
 
 		 696 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  64.15 
 
 		 686 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  100 
 
 		 683 aa  1410    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  50.29 
 
 		 705 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  49.13 
 
 		 711 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  48.51 
 
 		 678 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  49.56 
 
 		 722 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  49.56 
 
 		 686 aa  656    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  48.99 
 
 		 711 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  50.44 
 
 		 725 aa  679    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  48.41 
 
 		 711 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  48.84 
 
 		 711 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  69.97 
 
 		 677 aa  1017    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  64.98 
 
 		 683 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  49.86 
 
 		 729 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  65.13 
 
 		 683 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  48.41 
 
 		 711 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  50.07 
 
 		 716 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  50.37 
 
 		 721 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  51.81 
 
 		 703 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  64.15 
 
 		 686 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  64.15 
 
 		 686 aa  924    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  92.5 
 
 		 683 aa  1308    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  55 
 
 		 697 aa  768    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  49.27 
 
 		 711 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  70.5 
 
 		 683 aa  997    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  50.37 
 
 		 696 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  48.39 
 
 		 711 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  49.27 
 
 		 711 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  63.79 
 
 		 691 aa  910    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  49.13 
 
 		 711 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  64.3 
 
 		 686 aa  927    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  69.79 
 
 		 683 aa  1019    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  54.46 
 
 		 711 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  71.07 
 
 		 686 aa  1014    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  45.98 
 
 		 688 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  47.66 
 
 		 686 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  47.7 
 
 		 710 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.82 
 
 		 671 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  45.69 
 
 		 739 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  45.04 
 
 		 717 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  43.74 
 
 		 697 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  44.26 
 
 		 686 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  44.36 
 
 		 685 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  43.43 
 
 		 682 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  42.86 
 
 		 678 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  42.63 
 
 		 706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  42.63 
 
 		 706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  42.78 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  43.56 
 
 		 678 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  41.92 
 
 		 719 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  42.06 
 
 		 696 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.54 
 
 		 688 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.45 
 
 		 690 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  42.11 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  40.58 
 
 		 698 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  39.71 
 
 		 698 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  42.26 
 
 		 690 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  42.67 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  42.3 
 
 		 712 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.91 
 
 		 701 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  39.63 
 
 		 709 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  41.67 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.47 
 
 		 715 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.97 
 
 		 700 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  38.87 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  42 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  40.32 
 
 		 698 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  41.74 
 
 		 683 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  41.34 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.7 
 
 		 680 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  39.42 
 
 		 708 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  41.45 
 
 		 683 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.14 
 
 		 726 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  38.92 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  41.39 
 
 		 685 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  41.04 
 
 		 686 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  39.04 
 
 		 701 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  38.92 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  40.2 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.88 
 
 		 680 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.9 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  40.61 
 
 		 695 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  39.53 
 
 		 697 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  38.55 
 
 		 703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.48 
 
 		 709 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  41.82 
 
 		 682 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>