More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2328 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  49.78 
 
 
688 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  49.26 
 
 
721 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  100 
 
 
697 aa  1442    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  46.28 
 
 
671 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  46.2 
 
 
705 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  45.47 
 
 
685 aa  625  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  44.48 
 
 
678 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  44.87 
 
 
686 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.98 
 
 
711 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.54 
 
 
682 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  43.68 
 
 
697 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  44.66 
 
 
686 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  43.68 
 
 
686 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  44.58 
 
 
678 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.72 
 
 
710 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  45.66 
 
 
685 aa  576  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  43.34 
 
 
677 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  45.28 
 
 
703 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  43.74 
 
 
683 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  44.19 
 
 
688 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  43.77 
 
 
690 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  42.35 
 
 
683 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  42.35 
 
 
683 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  42.31 
 
 
686 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  42.35 
 
 
683 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  42.37 
 
 
686 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  43.39 
 
 
683 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  42.37 
 
 
686 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  41.83 
 
 
715 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  43.32 
 
 
683 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  42.37 
 
 
686 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  42.37 
 
 
686 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  42.37 
 
 
686 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  43.47 
 
 
696 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  42.22 
 
 
686 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  42.75 
 
 
691 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  42.07 
 
 
686 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  42.14 
 
 
686 aa  544  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  42.07 
 
 
696 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  41.85 
 
 
696 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  42.22 
 
 
717 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  42.22 
 
 
739 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  41.24 
 
 
729 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  41.84 
 
 
683 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.35 
 
 
699 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  41.84 
 
 
683 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  41.84 
 
 
683 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  41.84 
 
 
683 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  41.84 
 
 
683 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  42.88 
 
 
695 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  41.95 
 
 
698 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  41.79 
 
 
725 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  42.04 
 
 
719 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.1 
 
 
711 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  42.24 
 
 
711 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  40.09 
 
 
696 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  42.13 
 
 
711 aa  528  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  41.68 
 
 
711 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  41.39 
 
 
711 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  40.75 
 
 
701 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  42.1 
 
 
711 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  41.02 
 
 
698 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  41.54 
 
 
711 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  42.1 
 
 
711 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  41.39 
 
 
711 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.35 
 
 
680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.08 
 
 
690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  39.2 
 
 
722 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.12 
 
 
706 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.12 
 
 
706 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  40.97 
 
 
706 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  41.68 
 
 
702 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  41.68 
 
 
700 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  40.23 
 
 
709 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  40.08 
 
 
708 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  40.56 
 
 
680 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.33 
 
 
698 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  39.71 
 
 
678 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.61 
 
 
683 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  41.82 
 
 
702 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.41 
 
 
680 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.82 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.17 
 
 
683 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  39.04 
 
 
726 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  39.44 
 
 
716 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  40.8 
 
 
702 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  40.5 
 
 
702 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.71 
 
 
691 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  39.72 
 
 
713 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  37.61 
 
 
711 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.77 
 
 
700 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  40.03 
 
 
709 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  39.57 
 
 
719 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  39.04 
 
 
701 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  41.43 
 
 
686 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  38.63 
 
 
704 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.77 
 
 
695 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  39.19 
 
 
703 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.98 
 
 
756 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  40.23 
 
 
712 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>