More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1787 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01816  protease II  99.13 
 
 		 686 aa  1419    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  99.13 
 
 		 686 aa  1417    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  100 
 
 		 686 aa  1430    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  47.34 
 
 		 722 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  47.53 
 
 		 704 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  46.46 
 
 		 719 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  98.98 
 
 		 686 aa  1414    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  48.4 
 
 		 711 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  54.79 
 
 		 711 aa  796    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  50.15 
 
 		 721 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  48.55 
 
 		 711 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  60.48 
 
 		 686 aa  866    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  51.47 
 
 		 705 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  63.53 
 
 		 683 aa  923    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  64.15 
 
 		 683 aa  924    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  48.82 
 
 		 696 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  79.88 
 
 		 691 aa  1192    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  48.26 
 
 		 711 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  100 
 
 		 686 aa  1430    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  99.42 
 
 		 686 aa  1422    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  65.24 
 
 		 677 aa  939    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  47.36 
 
 		 686 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  61.97 
 
 		 683 aa  884    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  89.56 
 
 		 683 aa  1289    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  47.79 
 
 		 711 aa  671    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  49.7 
 
 		 703 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  47.72 
 
 		 716 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  52.49 
 
 		 697 aa  740    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  63.53 
 
 		 683 aa  923    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  63.26 
 
 		 683 aa  916    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  98.4 
 
 		 686 aa  1409    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  89.71 
 
 		 683 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  48.4 
 
 		 711 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  63.53 
 
 		 683 aa  923    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  99.13 
 
 		 686 aa  1419    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  48.53 
 
 		 696 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  47.13 
 
 		 725 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  48.54 
 
 		 711 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  46.71 
 
 		 671 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  46.68 
 
 		 729 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  48.09 
 
 		 686 aa  631  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  47.66 
 
 		 700 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  47.51 
 
 		 711 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  47.81 
 
 		 711 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  47.51 
 
 		 711 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  46.44 
 
 		 688 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  47.25 
 
 		 710 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  46.72 
 
 		 678 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  46.39 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  45.73 
 
 		 739 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  44.99 
 
 		 717 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  42.37 
 
 		 697 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.74 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  42.14 
 
 		 686 aa  522  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  41.84 
 
 		 682 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  42.88 
 
 		 685 aa  512  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  41.88 
 
 		 688 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.94 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.74 
 
 		 680 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.49 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  39.63 
 
 		 696 aa  495  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.65 
 
 		 678 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  40.3 
 
 		 678 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  41.79 
 
 		 690 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.86 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  39.68 
 
 		 699 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.56 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  39.56 
 
 		 715 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.86 
 
 		 680 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  38.35 
 
 		 698 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  38.29 
 
 		 698 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  40.18 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  39.86 
 
 		 709 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.62 
 
 		 685 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.87 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  38.32 
 
 		 697 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  38.43 
 
 		 709 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.5 
 
 		 684 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  39.12 
 
 		 708 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.22 
 
 		 702 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  38.45 
 
 		 690 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  39.8 
 
 		 713 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.22 
 
 		 702 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  38.22 
 
 		 719 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  38.51 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  38.82 
 
 		 698 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  38.36 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  38.72 
 
 		 702 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  38.36 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.16 
 
 		 701 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  38.98 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  37.68 
 
 		 703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  37.64 
 
 		 726 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  37.55 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  39.26 
 
 		 702 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  37.98 
 
 		 712 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  38.26 
 
 		 696 aa  452  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>