More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0982 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  56.92 
 
 
818 aa  1003    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  100 
 
 
838 aa  1726    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  41.4 
 
 
709 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  40.48 
 
 
782 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  37.87 
 
 
744 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  37.47 
 
 
739 aa  505  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  35.2 
 
 
726 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  49.58 
 
 
696 aa  350  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  49.29 
 
 
712 aa  349  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  50 
 
 
706 aa  349  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  50.14 
 
 
690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  49.71 
 
 
719 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  49.42 
 
 
706 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  49.42 
 
 
706 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  49.42 
 
 
706 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  49.86 
 
 
688 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  46.59 
 
 
726 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  47.54 
 
 
698 aa  320  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  48.86 
 
 
698 aa  320  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  48.1 
 
 
695 aa  320  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  47.43 
 
 
703 aa  313  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  40.74 
 
 
683 aa  307  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  44.41 
 
 
683 aa  301  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  41.11 
 
 
697 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.65 
 
 
685 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  43.93 
 
 
683 aa  294  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.94 
 
 
696 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  44.44 
 
 
748 aa  290  6e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  40.92 
 
 
719 aa  290  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  43.64 
 
 
686 aa  290  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  41.21 
 
 
671 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  43.19 
 
 
683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  43.19 
 
 
683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  43.19 
 
 
683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  36.96 
 
 
721 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.94 
 
 
696 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  38.46 
 
 
704 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  41.21 
 
 
686 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  41.33 
 
 
705 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.92 
 
 
685 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  40.97 
 
 
729 aa  279  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  37.33 
 
 
688 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.79 
 
 
678 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  41.67 
 
 
678 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  40.46 
 
 
684 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.11 
 
 
677 aa  276  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.17 
 
 
680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  41.62 
 
 
702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  41.62 
 
 
702 aa  275  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.79 
 
 
710 aa  273  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  42.12 
 
 
716 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  41.23 
 
 
722 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  42.4 
 
 
686 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  42.4 
 
 
686 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.74 
 
 
711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  42.11 
 
 
686 aa  270  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.78 
 
 
702 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  41.38 
 
 
701 aa  270  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  39.88 
 
 
680 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  40.22 
 
 
714 aa  269  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  39.29 
 
 
686 aa  268  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  41.43 
 
 
691 aa  268  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  38.36 
 
 
702 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  38.22 
 
 
711 aa  267  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  42.12 
 
 
683 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  42.12 
 
 
683 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  42.12 
 
 
683 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  42.12 
 
 
683 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  42.12 
 
 
683 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  41.38 
 
 
703 aa  266  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  39.31 
 
 
680 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  39.44 
 
 
710 aa  265  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  38.68 
 
 
725 aa  264  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  40.97 
 
 
715 aa  265  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  39.02 
 
 
680 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  40 
 
 
700 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  37.38 
 
 
715 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  40.86 
 
 
682 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  40.72 
 
 
699 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  40 
 
 
711 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.23 
 
 
713 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  38.87 
 
 
711 aa  260  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  39.72 
 
 
711 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  40.43 
 
 
714 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  39.44 
 
 
711 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  37.37 
 
 
709 aa  259  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  39.22 
 
 
711 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  37.39 
 
 
686 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.22 
 
 
711 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  38.94 
 
 
711 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  39.22 
 
 
711 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  40.86 
 
 
686 aa  259  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.06 
 
 
700 aa  257  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  37.71 
 
 
696 aa  257  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  41.04 
 
 
697 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>