More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  45.05 
 
 		 1232 aa  820    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  55.64 
 
 		 1320 aa  1206    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  44.83 
 
 		 1161 aa  862    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  52.33 
 
 		 1268 aa  1111    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  48 
 
 		 1152 aa  860    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  44.21 
 
 		 1166 aa  848    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  47.91 
 
 		 1155 aa  987    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1260 aa  2489    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.07 
 
 		 1145 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  32.4 
 
 		 1039 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.87 
 
 		 1156 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  30.29 
 
 		 1075 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  28.81 
 
 		 1225 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  31.26 
 
 		 1139 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.15 
 
 		 1134 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.3 
 
 		 1122 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  27.01 
 
 		 1181 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  25.53 
 
 		 1139 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  27.4 
 
 		 1127 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  28.61 
 
 		 1184 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  29.09 
 
 		 1190 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  28.63 
 
 		 1176 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 		 1143 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  31.85 
 
 		 1182 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  28.86 
 
 		 1143 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  26.35 
 
 		 1145 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  31.98 
 
 		 1084 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  27.42 
 
 		 1155 aa  396  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  27.86 
 
 		 1157 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  27.21 
 
 		 1156 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  29.86 
 
 		 1195 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1160 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  28.18 
 
 		 1179 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  28.01 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  29.68 
 
 		 1165 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  27.58 
 
 		 1159 aa  387  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  29.74 
 
 		 1130 aa  383  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  30.3 
 
 		 1087 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  30.14 
 
 		 1159 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  27.93 
 
 		 1159 aa  380  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  27.5 
 
 		 1157 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  33.92 
 
 		 1183 aa  380  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  28.44 
 
 		 1132 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  26.93 
 
 		 1159 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  27.73 
 
 		 1173 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  30.05 
 
 		 1093 aa  376  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  28.41 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  27.59 
 
 		 1158 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  31.05 
 
 		 1194 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  30.37 
 
 		 1031 aa  376  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  28.14 
 
 		 1159 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  30.7 
 
 		 1092 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  27.44 
 
 		 1173 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 		 1260 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  27.76 
 
 		 1158 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  28.07 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  29.21 
 
 		 1074 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  27.16 
 
 		 1186 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  25.45 
 
 		 1165 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  27.28 
 
 		 1156 aa  373  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  25.25 
 
 		 1165 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  25.3 
 
 		 1163 aa  373  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  29.81 
 
 		 1099 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  28.23 
 
 		 1171 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  27.67 
 
 		 1158 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  27.67 
 
 		 1158 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  29.81 
 
 		 1099 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  29.9 
 
 		 1099 aa  373  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  27.25 
 
 		 1180 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  27.26 
 
 		 1151 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  30.1 
 
 		 1073 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  29.83 
 
 		 1079 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  27.77 
 
 		 1172 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  28.32 
 
 		 1172 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  26.96 
 
 		 1155 aa  370  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  30.45 
 
 		 1168 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  28.14 
 
 		 1155 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  26.67 
 
 		 1157 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.85 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  24.44 
 
 		 1165 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  27.45 
 
 		 1175 aa  370  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  28.17 
 
 		 1160 aa  366  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  29.53 
 
 		 1090 aa  367  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  24.94 
 
 		 1165 aa  366  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  29.31 
 
 		 1040 aa  366  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  28.34 
 
 		 1160 aa  367  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  28.17 
 
 		 1160 aa  366  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  366  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  24.94 
 
 		 1165 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  27.7 
 
 		 1143 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  366  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1160 aa  366  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  26.27 
 
 		 1170 aa  366  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  31.17 
 
 		 1124 aa  366  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.12 
 
 		 1162 aa  365  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  27.06 
 
 		 1157 aa  365  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>