More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1752 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  41.14 
 
 
1026 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  41.98 
 
 
1026 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  41.38 
 
 
1026 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  42.28 
 
 
1061 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  38.4 
 
 
1085 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  40.93 
 
 
1047 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  50.38 
 
 
1194 aa  1005    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  70.5 
 
 
1099 aa  1513    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  41.23 
 
 
1031 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  41.55 
 
 
1075 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  41.66 
 
 
1031 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  42.04 
 
 
1027 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  39.85 
 
 
1082 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  40.15 
 
 
1036 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  42.04 
 
 
1023 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  41.72 
 
 
1049 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  40.3 
 
 
1025 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15740  DNA polymerase III, alpha subunit  54.28 
 
 
1141 aa  1093    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  41.91 
 
 
1026 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  42.6 
 
 
1049 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  39.81 
 
 
1053 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1441  DNA polymerase III, alpha subunit  56.34 
 
 
1185 aa  660    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  39.85 
 
 
1059 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  40.55 
 
 
1040 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  38.75 
 
 
1090 aa  641    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  38.32 
 
 
1045 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2944  DNA polymerase III subunit alpha  53.34 
 
 
1105 aa  1035    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000126736  decreased coverage  0.0000111947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  39.11 
 
 
1076 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  37.75 
 
 
1097 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 
1044 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  39.59 
 
 
1026 aa  701    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  41.66 
 
 
1026 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  38.55 
 
 
1055 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  42.6 
 
 
1049 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  62.95 
 
 
1092 aa  1278    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  37.6 
 
 
1074 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  39.22 
 
 
1087 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  52.77 
 
 
1073 aa  1032    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  59.11 
 
 
1124 aa  1183    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  41.67 
 
 
1070 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  55.12 
 
 
1173 aa  1124    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 
1090 aa  2204    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  70.5 
 
 
1099 aa  1513    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  42.96 
 
 
1024 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  39.85 
 
 
1059 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 
1043 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5240  DNA polymerase III, alpha subunit  52.25 
 
 
1127 aa  1036    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104039  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  39.75 
 
 
1096 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  40.47 
 
 
1033 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  38.38 
 
 
1087 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  40.4 
 
 
1072 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  41.85 
 
 
1025 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  69.94 
 
 
1079 aa  1440    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  40.71 
 
 
1093 aa  677    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  71.23 
 
 
1093 aa  1550    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  42.06 
 
 
1031 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  39.85 
 
 
1074 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  42.5 
 
 
1049 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  41.31 
 
 
1044 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  58.86 
 
 
1090 aa  1195    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  40.43 
 
 
1049 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  52.77 
 
 
1053 aa  955    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  50.9 
 
 
1145 aa  1037    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  69.6 
 
 
1087 aa  1501    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1187  DNA polymerase III, alpha subunit  49.5 
 
 
1093 aa  1008    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0053605  normal  0.0613953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  70.5 
 
 
1099 aa  1513    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  70.08 
 
 
1098 aa  1527    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  39.66 
 
 
1039 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21270  DNA polymerase III, alpha subunit  57.07 
 
 
1117 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0292605  normal  0.169671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  58.57 
 
 
1124 aa  1191    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  41.72 
 
 
1044 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  38.59 
 
 
1077 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  40.48 
 
 
1071 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  40.48 
 
 
1071 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  41.78 
 
 
1064 aa  635  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  40.2 
 
 
1071 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  38.61 
 
 
1077 aa  627  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  40 
 
 
1068 aa  628  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  37.43 
 
 
1097 aa  628  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  39.05 
 
 
1084 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  40.22 
 
 
1071 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  40.21 
 
 
1063 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  40.21 
 
 
1063 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  39.73 
 
 
1071 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  40.21 
 
 
1063 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  40.04 
 
 
1071 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  40.21 
 
 
1063 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  38.65 
 
 
1109 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  37.65 
 
 
1116 aa  622  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  40.43 
 
 
1072 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  38.36 
 
 
1145 aa  621  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  40.41 
 
 
1072 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  39.94 
 
 
1068 aa  621  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  40.43 
 
 
1072 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  41.23 
 
 
1075 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  39.64 
 
 
1071 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  38.48 
 
 
1116 aa  619  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  40.46 
 
 
1041 aa  622  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  40.8 
 
 
1071 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  41.23 
 
 
1076 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>