More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3155 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  40.77 
 
 		 1071 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  40.06 
 
 		 1085 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  41.34 
 
 		 1072 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  61.65 
 
 		 1124 aa  1258    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  40.45 
 
 		 1026 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  61.12 
 
 		 1124 aa  1266    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  42.35 
 
 		 1071 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  41.52 
 
 		 1047 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  39.85 
 
 		 1026 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  38.28 
 
 		 1077 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  40.98 
 
 		 1044 aa  665    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  41.64 
 
 		 1031 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  42.79 
 
 		 1063 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  41.72 
 
 		 1031 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  41.22 
 
 		 1026 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  42.01 
 
 		 1027 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  55.52 
 
 		 1194 aa  1142    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  43.28 
 
 		 1023 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  40.78 
 
 		 1026 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15740  DNA polymerase III, alpha subunit  56.58 
 
 		 1141 aa  1128    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  41.64 
 
 		 1049 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  42.88 
 
 		 1072 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  40.25 
 
 		 1109 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  40.74 
 
 		 1025 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1441  DNA polymerase III, alpha subunit  56.96 
 
 		 1185 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0417795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  38.68 
 
 		 1074 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  41.99 
 
 		 1059 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  41.64 
 
 		 1068 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  38.2 
 
 		 1087 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  43.03 
 
 		 1044 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5240  DNA polymerase III, alpha subunit  53.68 
 
 		 1127 aa  1081    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  37.95 
 
 		 1024 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  42.79 
 
 		 1063 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  41.11 
 
 		 1040 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  42.25 
 
 		 1049 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  43.12 
 
 		 1084 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  42.35 
 
 		 1049 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  42.79 
 
 		 1063 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  42.98 
 
 		 1072 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  38.92 
 
 		 1076 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  39.01 
 
 		 1145 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  39.29 
 
 		 1097 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  41.25 
 
 		 1084 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  63.04 
 
 		 1090 aa  1318    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2944  DNA polymerase III subunit alpha  54.7 
 
 		 1105 aa  1036    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000126736  decreased coverage  0.0000111947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  42.94 
 
 		 1024 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  38.18 
 
 		 1045 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  100 
 
 		 1092 aa  2198    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  38.88 
 
 		 1077 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  54.07 
 
 		 1073 aa  1037    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  42.79 
 
 		 1063 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  65.04 
 
 		 1099 aa  1392    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  39.29 
 
 		 1090 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  40.4 
 
 		 1087 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  53.91 
 
 		 1053 aa  971    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  40.87 
 
 		 1071 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  42.1 
 
 		 1070 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 		 1020 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1187  DNA polymerase III, alpha subunit  52.06 
 
 		 1093 aa  1037    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0053605  normal  0.0613953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  39.87 
 
 		 1015 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  41.81 
 
 		 1071 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  65.04 
 
 		 1099 aa  1392    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  40.09 
 
 		 1116 aa  666    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  41.67 
 
 		 1071 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  40.21 
 
 		 1082 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  41.28 
 
 		 1040 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  40.3 
 
 		 1096 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  40.94 
 
 		 1033 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  40.53 
 
 		 1099 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  42.17 
 
 		 1025 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21270  DNA polymerase III, alpha subunit  57.32 
 
 		 1117 aa  1145    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0292605  normal  0.169671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  41.63 
 
 		 1075 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  42.05 
 
 		 1093 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  42.07 
 
 		 1071 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  40.34 
 
 		 1053 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  43.26 
 
 		 1031 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  41.81 
 
 		 1071 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  41.27 
 
 		 1061 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  42.07 
 
 		 1049 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  42.79 
 
 		 1071 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  41.59 
 
 		 1059 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  40.65 
 
 		 1083 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  61.95 
 
 		 1090 aa  1254    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  66.7 
 
 		 1087 aa  1373    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  41.27 
 
 		 1026 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  39.23 
 
 		 1055 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  55.64 
 
 		 1145 aa  1147    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  39.65 
 
 		 1074 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  65.04 
 
 		 1099 aa  1392    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  65.28 
 
 		 1098 aa  1386    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  41.67 
 
 		 1026 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 		 1039 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  65.5 
 
 		 1079 aa  1325    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  42.24 
 
 		 1043 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  41.72 
 
 		 1076 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  43.61 
 
 		 1044 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  55.91 
 
 		 1173 aa  1140    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  63.15 
 
 		 1093 aa  1325    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  42.98 
 
 		 1072 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  41.46 
 
 		 1064 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>