More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3285 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  46.42 
 
 		 1232 aa  890    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  51.49 
 
 		 1152 aa  976    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  45.17 
 
 		 1161 aa  910    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  51.7 
 
 		 1155 aa  1102    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  52.33 
 
 		 1260 aa  1122    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  45.22 
 
 		 1166 aa  884    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1268 aa  2505    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  56.9 
 
 		 1320 aa  1271    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.68 
 
 		 1139 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.91 
 
 		 1134 aa  496  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.86 
 
 		 1145 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.57 
 
 		 1075 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.33 
 
 		 1145 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  31.9 
 
 		 1156 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.17 
 
 		 1225 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.19 
 
 		 1122 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  31.17 
 
 		 1156 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  29.06 
 
 		 1130 aa  439  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  30.6 
 
 		 1087 aa  436  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  28.81 
 
 		 1186 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  31.76 
 
 		 1099 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  31.85 
 
 		 1099 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  28.12 
 
 		 1127 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  31.85 
 
 		 1099 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  31.22 
 
 		 1182 aa  429  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  28.45 
 
 		 1181 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0174  DNA polymerase III subunit alpha  30.5 
 
 		 1193 aa  426  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.224841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 1195 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  29.14 
 
 		 1184 aa  426  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  32.71 
 
 		 1039 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  28.72 
 
 		 1170 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0153  DNA polymerase III subunit alpha  30.42 
 
 		 1193 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  26.31 
 
 		 1139 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  28.51 
 
 		 1156 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  32.44 
 
 		 1132 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  31.85 
 
 		 1079 aa  423  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  30.68 
 
 		 1159 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  30.76 
 
 		 1098 aa  423  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  27.82 
 
 		 1159 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  29.97 
 
 		 1174 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  29.46 
 
 		 1159 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  28.55 
 
 		 1170 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  32.5 
 
 		 1183 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  29.25 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  29.25 
 
 		 1160 aa  416  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  29.08 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  29.81 
 
 		 1186 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  29.25 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  32.09 
 
 		 1167 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  30.81 
 
 		 1158 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  29.21 
 
 		 1143 aa  416  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  27.23 
 
 		 1165 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  32.09 
 
 		 1166 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  29.21 
 
 		 1143 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  29.16 
 
 		 1160 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  29.25 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  32.69 
 
 		 1084 aa  416  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  29.25 
 
 		 1160 aa  416  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  29.25 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1160 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.06 
 
 		 1170 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 		 1165 aa  413  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  29.65 
 
 		 1176 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  29.92 
 
 		 1159 aa  412  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  28.97 
 
 		 1160 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  29.14 
 
 		 1160 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  29.14 
 
 		 1160 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  30.09 
 
 		 1168 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  29.14 
 
 		 1160 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  30.61 
 
 		 1073 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05648  DNA polymerase III subunit alpha  30.35 
 
 		 1196 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000434171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  29.05 
 
 		 1160 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  29.85 
 
 		 1174 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  29.2 
 
 		 1154 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  31.53 
 
 		 1090 aa  413  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  29.4 
 
 		 1162 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  30.34 
 
 		 1092 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  29.71 
 
 		 1174 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.72 
 
 		 1162 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  28.71 
 
 		 1157 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22680  DNA polymerase III, alpha subunit  30.15 
 
 		 1181 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  29.52 
 
 		 1173 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  25.91 
 
 		 1165 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  30.06 
 
 		 1157 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  29.6 
 
 		 1159 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  29.63 
 
 		 1174 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  28.53 
 
 		 1164 aa  410  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  28.8 
 
 		 1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  27.33 
 
 		 1149 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  29.53 
 
 		 1157 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  29.78 
 
 		 1180 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  29.2 
 
 		 1190 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  29.8 
 
 		 1174 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  29.79 
 
 		 1164 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  27.85 
 
 		 1156 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1251  DNA polymerase III subunit alpha  30.23 
 
 		 1196 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  30.03 
 
 		 1155 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  28.78 
 
 		 1173 aa  403  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  28.24 
 
 		 1109 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  25.91 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>