More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2570 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  48.09 
 
 		 1152 aa  890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  48.08 
 
 		 1260 aa  978    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 1155 aa  2303    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  45.01 
 
 		 1161 aa  880    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  51.85 
 
 		 1268 aa  1098    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  45.49 
 
 		 1166 aa  883    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  46.22 
 
 		 1232 aa  873    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  50.08 
 
 		 1320 aa  1092    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  34.06 
 
 		 1039 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.03 
 
 		 1145 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  29.54 
 
 		 1225 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.68 
 
 		 1134 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  30.67 
 
 		 1075 aa  436  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  31.07 
 
 		 1156 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.49 
 
 		 1139 aa  429  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.36 
 
 		 1145 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.33 
 
 		 1122 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  32.97 
 
 		 1084 aa  416  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  28.84 
 
 		 1127 aa  413  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  30.81 
 
 		 1026 aa  413  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  31.42 
 
 		 1073 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  30.93 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  27.9 
 
 		 1164 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  31.03 
 
 		 1026 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  29.14 
 
 		 1143 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  29.17 
 
 		 1156 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  29.76 
 
 		 1087 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  29.31 
 
 		 1143 aa  406  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.38 
 
 		 1182 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  30.37 
 
 		 1093 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  31.71 
 
 		 1090 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  28.15 
 
 		 1170 aa  403  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  26.63 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  29.89 
 
 		 1190 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  30.65 
 
 		 1159 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  30.5 
 
 		 1074 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  30.97 
 
 		 1026 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  30.31 
 
 		 1031 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  28.6 
 
 		 1184 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1165 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  29.21 
 
 		 1045 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  29.65 
 
 		 1132 aa  399  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  27.97 
 
 		 1170 aa  399  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  28.76 
 
 		 1160 aa  396  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  30.99 
 
 		 1026 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  30.02 
 
 		 1194 aa  396  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  29.1 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  31.86 
 
 		 1183 aa  396  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  28.76 
 
 		 1160 aa  396  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  30.84 
 
 		 1026 aa  396  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.2 
 
 		 1170 aa  396  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  27.76 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  30.19 
 
 		 1098 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.73 
 
 		 1162 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  31.64 
 
 		 1023 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  31.06 
 
 		 1090 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  28.75 
 
 		 1160 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  27.89 
 
 		 1110 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  28.75 
 
 		 1160 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  26.93 
 
 		 1108 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  28.76 
 
 		 1176 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  28.75 
 
 		 1160 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  28.75 
 
 		 1160 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  29.64 
 
 		 1180 aa  389  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  26.84 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  28.66 
 
 		 1160 aa  390  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  28.12 
 
 		 1160 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  26.84 
 
 		 1108 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  26.93 
 
 		 1108 aa  390  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  27.03 
 
 		 1108 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  27.03 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  25.93 
 
 		 1139 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  29.33 
 
 		 1260 aa  389  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  28.27 
 
 		 1055 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  30.17 
 
 		 1099 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  26.84 
 
 		 1108 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  27.61 
 
 		 1160 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  26.84 
 
 		 1108 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  30.4 
 
 		 1059 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.79 
 
 		 1168 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  30.48 
 
 		 1049 aa  390  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  27.4 
 
 		 1157 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  30.27 
 
 		 1099 aa  390  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  27.61 
 
 		 1171 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  28.9 
 
 		 1130 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 		 1059 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  28.2 
 
 		 1186 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  28.12 
 
 		 1158 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  30.37 
 
 		 1145 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  30.27 
 
 		 1099 aa  390  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  28.28 
 
 		 1158 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  29.94 
 
 		 1031 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  28.35 
 
 		 1076 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  28.88 
 
 		 1097 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>