More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3215 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  57.17 
 
 		 1268 aa  1261    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  45.13 
 
 		 1161 aa  912    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  50.15 
 
 		 1155 aa  1092    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  51.5 
 
 		 1152 aa  953    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1320 aa  2565    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  55.76 
 
 		 1260 aa  1218    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  44.82 
 
 		 1166 aa  903    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  47.58 
 
 		 1232 aa  912    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.9 
 
 		 1156 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.03 
 
 		 1139 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  29.33 
 
 		 1075 aa  422  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  31.42 
 
 		 1039 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.43 
 
 		 1145 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.97 
 
 		 1182 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  31.57 
 
 		 1084 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.09 
 
 		 1134 aa  410  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 		 1159 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  27.52 
 
 		 1225 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  27.75 
 
 		 1164 aa  406  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  29.03 
 
 		 1164 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4598  DNA polymerase III, alpha subunit  43.92 
 
 		 1280 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.744008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  32 
 
 		 1195 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  27.08 
 
 		 1158 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  28.64 
 
 		 1173 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  27.08 
 
 		 1158 aa  400  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  27.08 
 
 		 1158 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  33.92 
 
 		 1073 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  28.42 
 
 		 1159 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  27.16 
 
 		 1158 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  28.6 
 
 		 1159 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  27.72 
 
 		 1184 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  28.5 
 
 		 1174 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  27.91 
 
 		 1154 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  26.96 
 
 		 1157 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  28.56 
 
 		 1174 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  31.96 
 
 		 1183 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.74 
 
 		 1162 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.78 
 
 		 1168 aa  387  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  28.68 
 
 		 1185 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  27.74 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  28.64 
 
 		 1174 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  28.17 
 
 		 1176 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  27.11 
 
 		 1177 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  28.43 
 
 		 1148 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  31.29 
 
 		 1174 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  26.52 
 
 		 1157 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  34.36 
 
 		 1167 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  28.51 
 
 		 1173 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  34.36 
 
 		 1166 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  27.09 
 
 		 1157 aa  380  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  29 
 
 		 1165 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  26.37 
 
 		 1127 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  27.01 
 
 		 1157 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  28.54 
 
 		 1174 aa  380  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  28.26 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  28.88 
 
 		 1156 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  27.88 
 
 		 1179 aa  380  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  29.6 
 
 		 1087 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  30.75 
 
 		 1190 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  28.44 
 
 		 1130 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  29.42 
 
 		 1181 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  26.93 
 
 		 1157 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  28.09 
 
 		 1162 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  27.48 
 
 		 1157 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  27.2 
 
 		 1186 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  30.88 
 
 		 1158 aa  377  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.53 
 
 		 1170 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.09 
 
 		 1122 aa  377  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  30.56 
 
 		 1182 aa  376  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  27.54 
 
 		 1158 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  25.82 
 
 		 1163 aa  376  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  26.93 
 
 		 1157 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  27.37 
 
 		 1160 aa  373  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  27.37 
 
 		 1160 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  27.37 
 
 		 1160 aa  373  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  28.22 
 
 		 1170 aa  372  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  27.47 
 
 		 1160 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  27.37 
 
 		 1160 aa  373  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  27.88 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1160 aa  373  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  28.5 
 
 		 1143 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  29.55 
 
 		 1156 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  27.29 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  27.36 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  28.24 
 
 		 1159 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  27.47 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2887  DNA polymerase III subunit alpha  26.84 
 
 		 1157 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0886013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  27.37 
 
 		 1160 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  28.02 
 
 		 1170 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  27.29 
 
 		 1160 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  27.43 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  27.47 
 
 		 1160 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  27.94 
 
 		 1171 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  27.63 
 
 		 1160 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  25.81 
 
 		 1145 aa  370  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  28.93 
 
 		 1168 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  26.99 
 
 		 1167 aa  368  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  26.48 
 
 		 1155 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  26.3 
 
 		 1186 aa  370  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  27.29 
 
 		 1160 aa  370  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>