More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2044 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  44.16 
 
 		 1152 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  45.17 
 
 		 1268 aa  889    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  45.01 
 
 		 1155 aa  879    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  44.89 
 
 		 1320 aa  894    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1161 aa  2360    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  59.21 
 
 		 1232 aa  1273    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  44.7 
 
 		 1260 aa  857    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  85.22 
 
 		 1166 aa  2004    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.09 
 
 		 1156 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  29.58 
 
 		 1039 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  32.15 
 
 		 1084 aa  410  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  28.31 
 
 		 1145 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  29.31 
 
 		 1182 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  28.48 
 
 		 1075 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.75 
 
 		 1134 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  28.96 
 
 		 1139 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  27.65 
 
 		 1225 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  29 
 
 		 1162 aa  390  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  28.56 
 
 		 1087 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  28.96 
 
 		 1274 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0964  DNA polymerase III subunit alpha  28.56 
 
 		 1179 aa  386  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  29.03 
 
 		 1278 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  28.96 
 
 		 1686 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  28.96 
 
 		 1174 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  28.96 
 
 		 1174 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  28.96 
 
 		 1174 aa  383  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  27.77 
 
 		 1184 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  28.96 
 
 		 1174 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1253  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 		 1192 aa  379  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  27.93 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  29.06 
 
 		 1031 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1173 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  28.3 
 
 		 1177 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  29.65 
 
 		 1071 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  27.4 
 
 		 1127 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  28.3 
 
 		 1177 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  27.26 
 
 		 1170 aa  376  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2079  DNA polymerase III subunit alpha  28.47 
 
 		 1187 aa  376  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0447418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  28.14 
 
 		 1179 aa  376  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  28.21 
 
 		 1176 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2232  DNA polymerase III subunit alpha  28.61 
 
 		 1190 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  28.64 
 
 		 1026 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  28.69 
 
 		 1177 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  28.58 
 
 		 1099 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  27.16 
 
 		 1170 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  29.31 
 
 		 1044 aa  373  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  28.71 
 
 		 1026 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  29.16 
 
 		 1159 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.08 
 
 		 1170 aa  373  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  27.83 
 
 		 1097 aa  373  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  28.44 
 
 		 1193 aa  373  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  28.71 
 
 		 1087 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2336  DNA polymerase III subunit alpha  28.04 
 
 		 1175 aa  373  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.0606341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  28.65 
 
 		 1059 aa  373  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  28.53 
 
 		 1026 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  27.46 
 
 		 1043 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  30.12 
 
 		 1053 aa  369  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  27.87 
 
 		 1025 aa  370  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  27.44 
 
 		 1143 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  27.62 
 
 		 1143 aa  369  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  27.79 
 
 		 1168 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  29.02 
 
 		 1049 aa  370  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  28.62 
 
 		 1087 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  27.33 
 
 		 1039 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  27.75 
 
 		 1033 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  27.6 
 
 		 1097 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  27.78 
 
 		 1031 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  27.44 
 
 		 1175 aa  367  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  29.08 
 
 		 1059 aa  366  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  27.81 
 
 		 1160 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  27.66 
 
 		 1160 aa  365  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  27.11 
 
 		 1049 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1160 aa  365  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21270  DNA polymerase III, alpha subunit  29.25 
 
 		 1117 aa  365  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0292605  normal  0.169671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  30.18 
 
 		 1027 aa  364  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  27.01 
 
 		 1158 aa  364  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  27.81 
 
 		 1160 aa  365  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  28.94 
 
 		 1031 aa  364  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  29.95 
 
 		 1173 aa  364  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  28.36 
 
 		 1118 aa  363  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  27.72 
 
 		 1160 aa  363  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  27.13 
 
 		 1132 aa  363  8e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  27.65 
 
 		 1165 aa  363  9e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  26.02 
 
 		 1157 aa  363  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  28.3 
 
 		 1160 aa  363  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  28.86 
 
 		 1098 aa  363  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  27.96 
 
 		 1026 aa  362  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  30.89 
 
 		 1026 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  29.08 
 
 		 1075 aa  362  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  28.61 
 
 		 1099 aa  362  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  28.86 
 
 		 1003 aa  362  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  28.61 
 
 		 1099 aa  362  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  30.76 
 
 		 1071 aa  361  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  27.72 
 
 		 1160 aa  361  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  26.48 
 
 		 1074 aa  360  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  28.52 
 
 		 1099 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4621  error-prone DNA polymerase  30.13 
 
 		 1079 aa  360  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743632  normal  0.186746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>