More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1922 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1084 aa  2129    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  36.2 
 
 		 1156 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  37.1 
 
 		 1074 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  39 
 
 		 1039 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  33.8 
 
 		 1145 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  31.57 
 
 		 1127 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  32.37 
 
 		 1170 aa  529  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  34.58 
 
 		 1075 aa  528  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  31.9 
 
 		 1170 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  34.25 
 
 		 1164 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  33.24 
 
 		 1132 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.18 
 
 		 1170 aa  522  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  32.84 
 
 		 1130 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  35.46 
 
 		 1139 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30.21 
 
 		 1139 aa  515  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.38 
 
 		 1145 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  30.64 
 
 		 1165 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  32.56 
 
 		 1184 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  32.16 
 
 		 1045 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  31.35 
 
 		 1055 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  35.97 
 
 		 1059 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  34.3 
 
 		 1087 aa  505  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  35.69 
 
 		 1059 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  34.54 
 
 		 1087 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  32.48 
 
 		 1225 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  34.66 
 
 		 1079 aa  502  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.08 
 
 		 1134 aa  500  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 		 1076 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  32.77 
 
 		 1026 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  31.85 
 
 		 1155 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  33.69 
 
 		 1070 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  34.21 
 
 		 1087 aa  499  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  33.36 
 
 		 1082 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  32.59 
 
 		 1156 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  32.79 
 
 		 1179 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.95 
 
 		 1122 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  34.77 
 
 		 1049 aa  495  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  34.44 
 
 		 1073 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  31.63 
 
 		 1074 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  31.2 
 
 		 1181 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  32.11 
 
 		 1156 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  34.47 
 
 		 1098 aa  493  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  31.16 
 
 		 1157 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  32.38 
 
 		 1155 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  34.2 
 
 		 1033 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  33.67 
 
 		 1173 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  35.63 
 
 		 1031 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  37.36 
 
 		 1053 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  35.16 
 
 		 1026 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  33.08 
 
 		 1159 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  35.46 
 
 		 1096 aa  485  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  33.24 
 
 		 1097 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  32.23 
 
 		 1175 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  34.2 
 
 		 1026 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  33.78 
 
 		 1053 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  34.9 
 
 		 1116 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  33.92 
 
 		 1026 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  32.48 
 
 		 1085 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  33.46 
 
 		 1099 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  33.55 
 
 		 1099 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  33.57 
 
 		 1182 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1093 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  33.56 
 
 		 1099 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  33.74 
 
 		 1093 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  35.79 
 
 		 1090 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  33.55 
 
 		 1099 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  31.05 
 
 		 1162 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  34.33 
 
 		 1039 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  31.57 
 
 		 1155 aa  475  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  29.67 
 
 		 1167 aa  475  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  36.07 
 
 		 1047 aa  475  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  33.12 
 
 		 1159 aa  476  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  32.47 
 
 		 1160 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  30.16 
 
 		 1180 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  34.46 
 
 		 1036 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  34.29 
 
 		 1026 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  33.55 
 
 		 1165 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  35.59 
 
 		 1075 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  28.87 
 
 		 1122 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  33.09 
 
 		 1158 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  33.8 
 
 		 1072 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  30.95 
 
 		 1158 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  31.22 
 
 		 1157 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  34.8 
 
 		 1026 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  32.26 
 
 		 1182 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  29.28 
 
 		 1149 aa  467  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  32.5 
 
 		 1151 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  31.32 
 
 		 1157 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  30.07 
 
 		 1186 aa  466  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  33.55 
 
 		 1025 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  31.37 
 
 		 1157 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3346  DNA polymerase III subunit alpha  33.46 
 
 		 1142 aa  465  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  33.87 
 
 		 1092 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  30.92 
 
 		 1171 aa  466  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5240  DNA polymerase III, alpha subunit  34.79 
 
 		 1127 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  34.01 
 
 		 1031 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  31.62 
 
 		 1174 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  32.79 
 
 		 1090 aa  462  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.44 
 
 		 1165 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  32.54 
 
 		 1090 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>