More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2318 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  45.09 
 
 
1152 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  45.22 
 
 
1268 aa  862    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  44.05 
 
 
1260 aa  833    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  45.49 
 
 
1155 aa  884    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  85.22 
 
 
1161 aa  2003    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 
1166 aa  2362    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  59.08 
 
 
1232 aa  1256    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  44.28 
 
 
1320 aa  878    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4598  DNA polymerase III, alpha subunit  47.49 
 
 
1280 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.744008  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  30.28 
 
 
1039 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  29.15 
 
 
1156 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.59 
 
 
1134 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  28.17 
 
 
1145 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  27.64 
 
 
1225 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  29.79 
 
 
1026 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  29.99 
 
 
1026 aa  393  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  29.72 
 
 
1026 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  30.69 
 
 
1031 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  29.17 
 
 
1087 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  28.41 
 
 
1143 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  31.59 
 
 
1084 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  27.57 
 
 
1170 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  30.23 
 
 
1026 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  28.14 
 
 
1143 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  27.87 
 
 
1170 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  28.13 
 
 
1075 aa  386  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  28.63 
 
 
1182 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  29.57 
 
 
1162 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  28.72 
 
 
1139 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  28.78 
 
 
1031 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.22 
 
 
1170 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  28.67 
 
 
1082 aa  379  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  28.72 
 
 
1087 aa  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  28.39 
 
 
1159 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  28.93 
 
 
1025 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  28.91 
 
 
1033 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0964  DNA polymerase III subunit alpha  28.61 
 
 
1179 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449919  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  27.87 
 
 
1076 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  27.87 
 
 
1097 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  29.22 
 
 
1044 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  27.87 
 
 
1099 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  28.82 
 
 
1099 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2232  DNA polymerase III subunit alpha  28.31 
 
 
1190 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  28.05 
 
 
1097 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  28.91 
 
 
1099 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  28.31 
 
 
1177 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  27.09 
 
 
1055 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  28.91 
 
 
1059 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  28.91 
 
 
1099 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  27.82 
 
 
1165 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  29.51 
 
 
1031 aa  370  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  31.1 
 
 
1071 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  27.81 
 
 
1049 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  29.04 
 
 
1167 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  29.02 
 
 
1024 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  28.82 
 
 
1278 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  29.04 
 
 
1166 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  28.42 
 
 
1177 aa  370  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  29.58 
 
 
1087 aa  369  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  29.26 
 
 
1026 aa  370  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  28.42 
 
 
1177 aa  370  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  30.66 
 
 
1173 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  27.58 
 
 
1127 aa  366  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  28.94 
 
 
1174 aa  366  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  29.36 
 
 
1059 aa  365  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  27.97 
 
 
1132 aa  366  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2336  DNA polymerase III subunit alpha  28.16 
 
 
1175 aa  365  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.0606341 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  28.69 
 
 
1274 aa  365  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  28.14 
 
 
1184 aa  365  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  30.86 
 
 
1071 aa  365  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  28.02 
 
 
1160 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  28.85 
 
 
1174 aa  363  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  28.85 
 
 
1174 aa  363  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  28.28 
 
 
1176 aa  363  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  28.85 
 
 
1174 aa  363  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  27.64 
 
 
1070 aa  363  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  29.08 
 
 
1027 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  29.76 
 
 
1084 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  29.77 
 
 
1049 aa  362  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  27.91 
 
 
1160 aa  361  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  27.91 
 
 
1160 aa  361  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  28.61 
 
 
1686 aa  361  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  27.91 
 
 
1160 aa  361  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  27.91 
 
 
1160 aa  360  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  27.91 
 
 
1160 aa  360  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  27.93 
 
 
1160 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  360  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  27.93 
 
 
1160 aa  360  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  27.76 
 
 
1160 aa  360  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  27.91 
 
 
1160 aa  360  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4621  error-prone DNA polymerase  29.46 
 
 
1079 aa  360  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743632  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.07 
 
 
1168 aa  360  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  29.46 
 
 
1079 aa  360  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  26.26 
 
 
1074 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  30.32 
 
 
1075 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2079  DNA polymerase III subunit alpha  27.98 
 
 
1187 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0447418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  27.88 
 
 
1158 aa  360  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  27.93 
 
 
1160 aa  360  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  27.78 
 
 
1074 aa  359  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1253  DNA polymerase III subunit alpha  28.35 
 
 
1192 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>