120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1357 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1357  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.266924  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  36.06 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  29.22 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  26.46 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  29.95 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  30.17 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  22.01 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  26.16 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  21.97 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  26.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.63 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  22.75 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 662 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  21.62 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  24.2 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  25.47 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  24.55 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  28.19 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 132 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  26.11 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  42.37 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  34.41 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  20.71 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  24.52 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  23.33 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  24.19 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  23.15 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 148 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  35.29 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  32.26 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  32.26 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  28.02 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  32.93 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  27.46 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  31.82 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>