More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2238 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  88.58 
 
 		 221 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  74.18 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  76.77 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  72.68 
 
 		 210 aa  304  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  61.11 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  61.62 
 
 		 205 aa  247  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  58.59 
 
 		 208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  56.57 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  57.21 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  60.1 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  58 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  55.67 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  54.82 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  53.27 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  53.27 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  51.2 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  56.84 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  55.26 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  54.74 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  51.28 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  53.33 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  52.33 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  52.26 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  50.52 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  45.18 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  43.69 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  41.4 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  45.45 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  40.91 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  42.11 
 
 		 273 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  45.74 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  41.33 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.58 
 
 		 234 aa  98.2  7e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  40.56 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  40.69 
 
 		 166 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  37.5 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  40.69 
 
 		 166 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  38.96 
 
 		 176 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 177 aa  95.5  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  37.09 
 
 		 166 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  38.1 
 
 		 176 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  42.22 
 
 		 178 aa  92  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  42.22 
 
 		 178 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  40.13 
 
 		 168 aa  91.7  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 		 172 aa  91.7  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  35 
 
 		 169 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  35.93 
 
 		 172 aa  91.7  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 		 172 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  34.73 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  34.01 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 		 174 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  34.09 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  35.76 
 
 		 166 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 		 173 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  38.31 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 172 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 172 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  40.82 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 172 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  38 
 
 		 165 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  35.57 
 
 		 180 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 		 180 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  34.13 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  37.35 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  36.36 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  34 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  40 
 
 		 172 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  34 
 
 		 173 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  32.89 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  38.78 
 
 		 169 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>