More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2312 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  92.38 
 
 		 210 aa  397  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  76.77 
 
 		 218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  71.92 
 
 		 215 aa  304  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  73.6 
 
 		 221 aa  301  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  62.69 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  64.04 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  61.69 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  63.92 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  61.86 
 
 		 205 aa  257  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  62.18 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  60.62 
 
 		 205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  57.87 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  59.39 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  54.45 
 
 		 229 aa  227  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  54.45 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  53.4 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  54.74 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  49.75 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  53.09 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 202 aa  217  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  53.23 
 
 		 225 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  51.85 
 
 		 205 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  47.64 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  45.13 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  43.39 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  42.35 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  40.98 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  43.15 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  43.65 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.39 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  42.76 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  39.22 
 
 		 165 aa  101  8e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  42.07 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  40.4 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  40.14 
 
 		 166 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  38.41 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  36.02 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.84 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  34.13 
 
 		 170 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  35.8 
 
 		 165 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  35.44 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  37.13 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  36.53 
 
 		 172 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  35.44 
 
 		 173 aa  91.7  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  35.44 
 
 		 173 aa  91.7  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  40.37 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  34.15 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  36.42 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  37.2 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  34.18 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  39.04 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  37.5 
 
 		 174 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  36.53 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  40.65 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  34.73 
 
 		 171 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  34.73 
 
 		 171 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 		 173 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  33.95 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  38.1 
 
 		 169 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 172 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  34.73 
 
 		 171 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  40.13 
 
 		 168 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  34.66 
 
 		 172 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  36.05 
 
 		 176 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 167 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 167 aa  88.6  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 167 aa  88.2  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 167 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 167 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 167 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  38.57 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  38.78 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 167 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  38.57 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  34.55 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>