More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0584 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  79.23 
 
 		 207 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  79.02 
 
 		 205 aa  340  5.999999999999999e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  77.07 
 
 		 205 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  72.91 
 
 		 205 aa  316  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  64.65 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  65.17 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  65.17 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  65.46 
 
 		 210 aa  263  8.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  63.92 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  61.62 
 
 		 218 aa  247  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  58.59 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  60.1 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  58.59 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  59.28 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  57.73 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  57.22 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  57.73 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  56.7 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  57 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  58.95 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  54.08 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  52.88 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  47.09 
 
 		 238 aa  188  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  48.15 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  42.93 
 
 		 256 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  44.04 
 
 		 273 aa  161  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  44.21 
 
 		 264 aa  158  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.75 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  44.37 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  41.03 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  42.57 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  42.57 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  41.22 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  41.22 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 		 169 aa  101  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 		 166 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  38.51 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  37.41 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  40.88 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  38.96 
 
 		 168 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  41.78 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  36 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  38.16 
 
 		 168 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  42.47 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  38.89 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  40.54 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  40.27 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  38.93 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  37.58 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  40.65 
 
 		 167 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  37.67 
 
 		 165 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  37.67 
 
 		 165 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 164 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  38 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  41.89 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  41.26 
 
 		 166 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.25 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  36.49 
 
 		 162 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  41.26 
 
 		 166 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  41.78 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  37.33 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  37.42 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  37.33 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  37.33 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  37.33 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  41.26 
 
 		 166 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  38.31 
 
 		 173 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 169 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  37.84 
 
 		 177 aa  89  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 166 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 147 aa  88.6  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 		 147 aa  88.6  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  35.81 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  36 
 
 		 175 aa  88.2  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  37.16 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  39.73 
 
 		 146 aa  88.2  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  40.54 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  36 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  37.01 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  37.91 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>