More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0779 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  90.59 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  88.61 
 
 		 202 aa  382  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  89.34 
 
 		 197 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  69.19 
 
 		 205 aa  295  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  69.27 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  58.38 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  58.08 
 
 		 205 aa  244  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  59.07 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  55.67 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  59.07 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  59.07 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  56.92 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  57.14 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  57.22 
 
 		 205 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  57.51 
 
 		 207 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  55.44 
 
 		 205 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  55.15 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  56.41 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  55.56 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 210 aa  217  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  58.03 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  56.84 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  55.61 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  51.03 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  49.74 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  49.74 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  49.47 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  47.18 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  49.48 
 
 		 252 aa  175  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  46.39 
 
 		 273 aa  174  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  47.92 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  40.67 
 
 		 176 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  39.31 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  39.31 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 		 173 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  32.03 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  35.57 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  31.37 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  34.59 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  31.37 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  35.34 
 
 		 172 aa  85.1  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  34.9 
 
 		 168 aa  84.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  32.41 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  34.59 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  33.78 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  36.05 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  32.89 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  30.07 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  36.36 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  34.46 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  33.78 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  36.05 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  34.01 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  32.21 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  32.41 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  34.03 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  34.03 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  34.03 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  32.43 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  36.05 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  32.43 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  35.42 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  35.42 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  34.93 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  32.7 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  33.99 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  32.88 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>