More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1632 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  337  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  65.12 
 
 		 172 aa  224  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  64.88 
 
 		 172 aa  221  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  62.8 
 
 		 173 aa  208  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  61.59 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  60.59 
 
 		 172 aa  204  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  59.41 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  57.65 
 
 		 172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  58.24 
 
 		 172 aa  197  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  59.41 
 
 		 171 aa  194  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  61.25 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  62.8 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  66.86 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  65.12 
 
 		 171 aa  187  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  62.79 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  58.58 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 162 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  62.34 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  55.69 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  58.75 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  61.04 
 
 		 169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  61.04 
 
 		 169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.23 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  60.39 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 165 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 165 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  57.89 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  52.12 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 202 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  56.05 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55.19 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  57.24 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  58.71 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  48.55 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  52.47 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  56.58 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>