More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2602 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  88.2 
 
 
163 aa  290  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  63.09 
 
 
177 aa  203  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  50.34 
 
 
190 aa  168  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 
166 aa  167  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.73 
 
 
166 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 
166 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
166 aa  165  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
166 aa  165  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 
166 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  57.04 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  51.35 
 
 
206 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.53 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  52.94 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 
166 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.41 
 
 
173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.67 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  50 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  51.63 
 
 
165 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  53.79 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  52.29 
 
 
167 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  51.01 
 
 
172 aa  159  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 
176 aa  158  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  51.02 
 
 
168 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  51.02 
 
 
168 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  51.68 
 
 
200 aa  157  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  51.35 
 
 
166 aa  158  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  56.83 
 
 
178 aa  157  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  56.83 
 
 
178 aa  157  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  52.38 
 
 
176 aa  157  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  49.34 
 
 
179 aa  157  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 
168 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  48.7 
 
 
169 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  48.67 
 
 
172 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  48.7 
 
 
169 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  50 
 
 
182 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  48.67 
 
 
180 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 
163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  49.66 
 
 
165 aa  154  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  48.7 
 
 
169 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  49.67 
 
 
176 aa  155  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  47.4 
 
 
163 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  54.68 
 
 
147 aa  155  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 
171 aa  154  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  48 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  47.1 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  51.25 
 
 
205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  52.38 
 
 
172 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  51.77 
 
 
161 aa  154  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 
166 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 
168 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  51.35 
 
 
197 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 
172 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  48 
 
 
180 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  52.41 
 
 
159 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  46.62 
 
 
169 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  50.34 
 
 
172 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  46.45 
 
 
172 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 
172 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  48.37 
 
 
168 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  48.37 
 
 
168 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 
177 aa  150  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  51.35 
 
 
182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  53.96 
 
 
158 aa  150  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  53.57 
 
 
147 aa  149  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  47.71 
 
 
223 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  47.71 
 
 
223 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  47.71 
 
 
223 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  49.06 
 
 
210 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  49.32 
 
 
215 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 
146 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  47.4 
 
 
163 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  49.32 
 
 
254 aa  148  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  46.98 
 
 
173 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  46.41 
 
 
222 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  53.24 
 
 
147 aa  148  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  53.24 
 
 
147 aa  148  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  49.01 
 
 
172 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  53.24 
 
 
147 aa  148  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  49.01 
 
 
205 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  47.71 
 
 
202 aa  148  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  49.38 
 
 
199 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  46.41 
 
 
225 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>