More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1309 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 		 176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  69.94 
 
 		 176 aa  244  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.97 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 206 aa  177  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  55.63 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  52.53 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  56.76 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  52.47 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 168 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 165 aa  168  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  55.48 
 
 		 168 aa  168  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  50.93 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 190 aa  167  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 210 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  50.92 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  53.38 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  52.6 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  50.58 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  46.58 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  51.52 
 
 		 165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>