More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3007 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
179 aa  356  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  81.03 
 
 
180 aa  278  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  79.31 
 
 
180 aa  274  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  70.25 
 
 
182 aa  224  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  64.42 
 
 
166 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  63.35 
 
 
190 aa  204  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  61.64 
 
 
173 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  61.11 
 
 
166 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  60.49 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
166 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  58.64 
 
 
168 aa  194  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 
169 aa  193  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 
169 aa  193  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  59.26 
 
 
166 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.26 
 
 
166 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.04 
 
 
168 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 
166 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 
166 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 
163 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 
168 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 
167 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
162 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.5 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 
162 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  55.36 
 
 
168 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  52.87 
 
 
179 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
162 aa  185  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
162 aa  185  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  185  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  183  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  54.04 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
172 aa  182  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
172 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 
172 aa  180  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
172 aa  179  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  53.66 
 
 
172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  53.66 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  56.25 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  53.66 
 
 
172 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 
171 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  52.35 
 
 
173 aa  177  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  54.66 
 
 
166 aa  177  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.21 
 
 
167 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 
165 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 
165 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  55.97 
 
 
215 aa  174  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  53.14 
 
 
199 aa  174  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 
200 aa  173  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.69 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  55.92 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  56.71 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 
163 aa  171  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 
163 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  56.69 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  56.6 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  55.97 
 
 
205 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  57.24 
 
 
182 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  56.96 
 
 
205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
225 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  58.11 
 
 
161 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 
208 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 
223 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  52.98 
 
 
163 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 
223 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 
223 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  53.7 
 
 
172 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.05 
 
 
197 aa  167  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 
202 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 
163 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 
173 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 
202 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 
174 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  51.53 
 
 
173 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
236 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  47.24 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 
171 aa  165  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 
171 aa  165  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 
147 aa  165  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 
167 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
238 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>