More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0491 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  339  9e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  99.42 
 
 		 172 aa  337  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  98.26 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 166 aa  180  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.04 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.66 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  54.66 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  58.62 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  56.44 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 164 aa  174  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 172 aa  174  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  50.63 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 180 aa  170  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  52.47 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  55.28 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  53.75 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  52.8 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  51.53 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  53.69 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  55.86 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  51.23 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  51.23 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  47.02 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  51.72 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  50.6 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 190 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  47.47 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  52.03 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  49.08 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  48.43 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  47.47 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 191 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  52 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2355  30S ribosomal protein S5  49.02 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  48.5 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  48.5 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  49.4 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  53.74 
 
 		 153 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 170 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  48.37 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  49.06 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  51.19 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  53.1 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  51.68 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>