More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2212 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
172 aa  338  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  94.19 
 
 
172 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  92.44 
 
 
172 aa  323  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  92.44 
 
 
172 aa  321  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  90.12 
 
 
172 aa  316  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  90.12 
 
 
172 aa  314  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  91.86 
 
 
171 aa  310  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  63.41 
 
 
166 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  59.41 
 
 
172 aa  203  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  61.18 
 
 
166 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  60 
 
 
172 aa  202  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  63.69 
 
 
162 aa  200  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  59.26 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 
166 aa  198  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 
162 aa  197  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.38 
 
 
173 aa  197  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  59.63 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.88 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 
162 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
162 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
166 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 
166 aa  193  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
162 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
166 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  59.74 
 
 
182 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  58.93 
 
 
168 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 
169 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 
166 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 
169 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  57.65 
 
 
166 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  57.79 
 
 
166 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 
169 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
174 aa  189  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.05 
 
 
166 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
166 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.66 
 
 
166 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 
163 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 
173 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 
174 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 
168 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 
172 aa  184  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.69 
 
 
173 aa  184  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
163 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  56.47 
 
 
167 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  58.94 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  59.73 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  57.06 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  62.65 
 
 
172 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 
210 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
167 aa  180  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.41 
 
 
175 aa  180  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
200 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
165 aa  180  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
163 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 
163 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 
165 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 
165 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  58.97 
 
 
197 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 
169 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  54.78 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
172 aa  177  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
172 aa  176  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 
163 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  54.94 
 
 
182 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
172 aa  175  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
163 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 
171 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 
202 aa  174  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 
202 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  58.67 
 
 
161 aa  174  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 
180 aa  174  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  58.49 
 
 
199 aa  174  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  53.75 
 
 
172 aa  174  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 
180 aa  173  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  58.55 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  55.84 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  48.85 
 
 
189 aa  171  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  58.55 
 
 
205 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  56.58 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 
169 aa  170  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
170 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  57.24 
 
 
205 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 
167 aa  167  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>