More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2035 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  98.82 
 
 		 169 aa  326  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  90.96 
 
 		 168 aa  298  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  72.39 
 
 		 166 aa  233  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  71.78 
 
 		 166 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  69.33 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  68.94 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 162 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  69.38 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  71.34 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  68.1 
 
 		 166 aa  220  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  67.7 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  71.15 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  71.15 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  67.08 
 
 		 168 aa  213  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  68.59 
 
 		 162 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  66.26 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  70.51 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  69.38 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  69.23 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  66.26 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 163 aa  210  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  66.03 
 
 		 163 aa  208  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  66.46 
 
 		 167 aa  207  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  64.29 
 
 		 168 aa  207  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  65.22 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  64.97 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  63.06 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  62.65 
 
 		 168 aa  201  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  67.95 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 180 aa  200  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  63.92 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 171 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  67.1 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 179 aa  193  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 		 169 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  61.25 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  63.29 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 172 aa  187  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 190 aa  184  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  59.63 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  64.43 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 170 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  56.36 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  67.12 
 
 		 200 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  67.12 
 
 		 202 aa  178  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  67.12 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  55.95 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  65.07 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  66.44 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 210 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  62 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  58.62 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  63.09 
 
 		 225 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  64.38 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  64.47 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  64.38 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 165 aa  174  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_433  ribosomal protein S5  57.53 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  59.63 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  61.96 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  61.84 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>