More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0411 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  64.85 
 
 		 170 aa  222  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  63.25 
 
 		 166 aa  217  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  65.43 
 
 		 170 aa  217  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  65.66 
 
 		 166 aa  217  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  63.86 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  63.86 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  63.25 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  64.85 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 		 168 aa  213  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 		 168 aa  213  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  62.65 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  62.65 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  62.65 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  62.05 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  62.05 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  62.05 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  62.05 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 171 aa  210  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 171 aa  210  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 166 aa  210  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  63.19 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2355  30S ribosomal protein S5  65.61 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  61.82 
 
 		 167 aa  207  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  60.49 
 
 		 165 aa  207  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 166 aa  207  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  60.61 
 
 		 167 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 168 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 168 aa  204  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  58.79 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  62.89 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  64.52 
 
 		 167 aa  203  7e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2307  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  201  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0773  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.554764  normal  0.012841 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  62.99 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  62.34 
 
 		 166 aa  201  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  62.99 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  62.34 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04503  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 180 aa  201  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0312  ribosomal protein S5  59.28 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00213866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>