More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2517 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  98.93 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  98.93 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  87.79 
 
 		 188 aa  298  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  90.12 
 
 		 191 aa  294  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  86.39 
 
 		 187 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  87.58 
 
 		 197 aa  284  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  73.94 
 
 		 186 aa  268  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  73.84 
 
 		 191 aa  250  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 192 aa  247  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 192 aa  247  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 192 aa  247  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  71.84 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  78.06 
 
 		 192 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  72.56 
 
 		 201 aa  245  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  72.89 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  76.28 
 
 		 195 aa  245  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  71.68 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  70.62 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  71.26 
 
 		 189 aa  244  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  71.26 
 
 		 189 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  76.28 
 
 		 190 aa  244  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  70.11 
 
 		 189 aa  243  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  68.97 
 
 		 189 aa  243  9e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  74.38 
 
 		 190 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  71.75 
 
 		 189 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  76.13 
 
 		 191 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  76.13 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  76.13 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  74.84 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  69.19 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  75.32 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  73.55 
 
 		 186 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  72.9 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  68.26 
 
 		 199 aa  231  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  71.15 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  68.71 
 
 		 239 aa  221  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  70.44 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  73.25 
 
 		 237 aa  217  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  56.73 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  58.43 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  56.47 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  57.99 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  58.68 
 
 		 173 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 172 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  56.47 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  56.14 
 
 		 169 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 172 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  56.89 
 
 		 173 aa  194  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  56.89 
 
 		 173 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  57.83 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  56.02 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  57.49 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  52.69 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  55.09 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  52.49 
 
 		 174 aa  187  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  59.12 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  55.23 
 
 		 170 aa  184  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  56.02 
 
 		 168 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 171 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  55.28 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>